Nápověda

Butenko Anzhelika

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 22

0575164 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Albanaz, A.T.S. - Carrington, M. - Frolov, A. - Ganyukova, A.I. - Gerasimov, E. S. - Kostygov, A.Y. - Lukeš, Julius - Malysheva, M. N. - Votýpka, Jan - Zakharova, A. - Záhonová, Kristýna - Zimmer, S.L. - Yurchenko, V. - Butenko, Anzhelika
Shining the spotlight on the neglected: new high-quality genome assemblies as a gateway to understanding the evolution of Trypanosomatidae.
BMC Genomics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 471. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Trypanosomatids * Genome assembly * Whole-genome sequencing * Monoxenous * Dixenous * Parasite * Protist
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2023 ; AIS: 1.116, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09591-z
Yurchenko, V.
- Butenko, Anzhelika
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345274

0603879 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bartošová-Sojková, Pavla - Butenko, Anzhelika - Richtová, Jitka - Fiala, Ivan - Oborník, Miroslav - Lukeš, Julius
Inside the Host: Understanding the Evolutionary Trajectories of Intracellular Parasitism.
Annual Review of Microbiology. Roč. 78, APR (2024), s. 39-59. ISSN 0066-4227. E-ISSN 1545-3251
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S; GA ČR(CZ) GX19-28399X; GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome reduction * apicomplexan * microsporidia * chromera * invasion * diversity * phylogeny * reveals * spp. * cell * symbiosis * intracellular parasite * parallel evolution * adaptation * genomic * features * comparative analysis
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 9.9, rok: 2024 ; AIS: 5.061, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1146/annurev-micro-041222-025305

Bartošová-Sojková, Pavla Oborník, Miroslav
- Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361177

0582762 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Butenko, Anzhelika - Lukeš, Julius - Speijer, D. - Wideman, J.
Mitochondrial genomes revisited: why do different lineages retain different genes?
BMC Biology. Roč. 22, č. 1 (2024), č. článku 15. ISSN 1741-7007. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: s19 ribosomal-protein * transfer-rna genes * yeast mitochondria * evolutionary inference * phototrophic relatives * organellar genomes * redox regulation * nucleus * mutation * dna * CoRR hypothesis * Evolutionary cell biology * Endosymbiont gene transfer * Mitochondrial DNA * Mitochondrial evolution * Mitochondrial mutation rates
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-024-01824-1
Wideman, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362226

0636806 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Galan, A. - Kraeva, N. - Záhonová, Kristýna - Butenko, Anzhelika - Kostygov, A. Y. - Paris, Zdeněk - Pergner, J. - Bianchi, C. - Fakih, Fadel - Saura, A. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
Converting Blastocrithidia Nonstop, a Trypanosomatid With Non-Canonical Genetic Code, Into a Genetically-Tractable Model.
Molecular Microbiology. Roč. 123, č. 6 (2025), s. 586-592. ISSN 0950-382X. E-ISSN 1365-2958
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GF23-08669L
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: metabolism * diversity * genomics * parasite * codon reassignment * CRISPR-Cas9 * genetic code * model organism * trypanosomatids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.6, rok: 2024 ; AIS: 1.101, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/mmi.15365
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367799

0619441 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gerasimov, E. S. - Afonin, D.A. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Saura, A. - Trusina, N. - Gahura, Ondřej - Zakharova, A. - Butenko, Anzhelika - Baráth, P. - Horváth, A. - Opperdoes, F. R. - Perez-Morga, D. - Zimmer, S.L. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
Evolutionary divergent kinetoplast genome structure and RNA editing patterns in the trypanosomatid Vickermania
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 122, č. 15 (2025), č. článku e2426887122. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S; GA ČR(CZ) GA23-07695S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: minicircle genome * mitochondrial * complex * replication * synthase * organization * Vickermania * RNA editing * trypanosomatids * ATP synthase * kinetoplast DNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 9.1, rok: 2024 ; AIS: 4.117, rok: 2024
Způsob publikování: Open access s časovým embargem
https://doi.org/10.1073/pnas.2426887122
Lukeš, Julius
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367790

0586440 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Grybchuk, D. - Galan, A. - Klocek, D. - Macedo, D.H. - Wolf, A. - Votýpka, Jan - Butenko, Anzhelika - Lukeš, Julius - Neri, U. - Záhonová, Kristýna - Kostygov, A. Y. - Koonin, E. - Yurchenko, V.
Identification of diverse RNA viruses in Obscuromonas flagellates (Euglenozoa: Trypanosomatidae: Blastocrithidiinae).
Virus Evolution. Roč. 10, č. 1 (2024), č. článku veae037. E-ISSN 2057-1577
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-14356S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genetic-code * alignment * sequence * evolution * genomics * codons * fungus * genus * Obscuromonas * Blastocrithidia * dsRNA viruses * Narnaviridae * Mitoviridae * Qin-like virus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 1.628, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/ve/veae037
Koonin, E.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361583

0604262 - BC 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Chmelová, Ľ. - Kraeva, N. - Saura, A. - Krayzel, A. - Vieira, C. S. - Ferreira, T. N. - Soares, R.P. - Bučková, B. - Galan, A. - Horáková, Eva - Vojtková, B. - Sádlová, J. - Malysheva, M. N. - Butenko, Anzhelika - Prokopchuk, Galina - Frolov, A. O. - Lukeš, Julius - Horváth, A. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Feder, D. - Kostygov, A. Y. - Yurchenko, V.
Intricate balance of dually-localized catalase in /Leptomonas seymouri/ (Kinetoplastea: Trypanosomatidae) modulates infectivity.
International Journal for Parasitology. Roč. 54, č. 8-9 (2024), s. 391-400. ISSN 0020-7519. E-ISSN 1879-0135
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-09283S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: hydrogen-peroxide * monoxenous trypanosomatids * superoxide-dismutase * leishmania-mexicana * cytosolic catalase * toxoplasma-gondii * expression system * identification * gene * peroxisomes * Trypanosomatids * Hydrogen peroxide * Catalase
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 1.011, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2024.04.007
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361617

0602930 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kostygov, A.Y. - Skypalova, K. - Kraeva, N. - Kalita, E. - Mcleod, C. - Yurchenko, V. - Field, Mark Christian - Lukeš, Julius - Butenko, Anzhelika
Comprehensive analysis of the Kinetoplastea intron landscape reveals a novel intron-containing gene and the first exclusively trans-splicing eukaryote.
BMC Biology. Roč. 22, č. 1 (2024), č. článku 281. ISSN 1741-7007. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07695S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rna helicase dbp2 * small nuclear-rna * trypanosoma-brucei * spliceosomal introns * domain proteins * genome * alignment * identification * visualization * families * Kinetoplastea * Trypanosomatidae * Introns * Splicing * Poly(A) polymerase * RNA helicase * RNA-binding protein
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12915-024-02080-z
Butenko, Anzhelika
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361884

0584662 - BC 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kostygov, A.Y. - Albanaz, A.T.S. - Butenko, Anzhelika - Gerasimov, E. S. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
Phylogenetic framework to explore trait evolution in Trypanosomatidae.
Trends in Parasitology. Roč. 40, č. 2 (2024), s. 96-99. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07695S; GA ČR(CZ) GA22-01026S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genomes * phylogenomics * trypanosomatids
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 6.6, rok: 2024 ; AIS: 2.602, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.pt.2023.11.009

Kostygov, A.Y. Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361883

0562196 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lukeš, Julius - Kachale, Ambar - Votýpka, Jan - Butenko, Anzhelika - Field, Mark Christian
African trypanosome strategies for conquering new hosts and territories: the end of monophyly?
Trends in Parasitology. Roč. 38, č. 9 (2022), s. 724-736. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA ČR(CZ) GA21-09283S; GA ČR(CZ) GA20-07186S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: African * strategies * territories
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.6, rok: 2022 ; AIS: 2.593, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471492222001143?via%3Dihub
Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339441

0604214 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Markowitz, A. G. - Nearman, A. - Zhao, Z. - Boncristiani, D. - Butenko, Anzhelika - de Pablos, L.M. - Marín, A. - Xu, G. - Machado, C.A. - Schwarz, R.S. - Palmer-Young, E.C. - Evans, J.D.
Somy evolution in the honey bee infecting trypanosomatid parasite Lotmaria passim.
G3-Genes, Genomes, Genetics. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku jkae258. ISSN 2160-1836. E-ISSN 2160-1836
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: apis-mellifera colonies * crithidia-mellificae * alignment * genome * pcr * visualization * annotation * package * format * Lotmaria passim strain BRL * atcc pra-422 * Leishmaniinae * Trypanosomatidae * trypanosomatid * PacBio * Hi-C * monoxenous * polyploidy * aneuploidy
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.82, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/g3journal/jkae258
Palmer-Young, E.C.
- Evans, J.D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362059

0642912 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nearman, A. - Butenko, Anzhelika - Evans, J.D. - Palmer-Young, E.C.
Chromosome-level genome assembly of trypanosomatid parasite Lotmaria passim links chromosome duplication and divergence with infection of honey bees.
BMC Genomics. Roč. 26, č. 1 (2025), č. článku 1083. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07695S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: gene-expression * adaptive-mechanisms * r package * leishmania * virulence * aneuploidy * evolution * telomeres * reveals * kegg * Aneuploidy * Trypanosomatid ancestral supernumerary chromosome * Gene duplication * Phylogenomics * Polycistronic genome organization * Post-transcriptional gene regulation * Differential gene expression * Host-parasite interactions * Crithidia
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.031, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12864-025-12082-y
Evans, J.D.
- Palmer-Young, E.C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372918

0580593 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Prokopchuk, Galina - Butenko, Anzhelika - Dacks, Joel Bryan - Speijer, D. - Field, Mark Christian - Lukeš, Julius
Lessons from the deep: mechanisms behind diversification of eukaryotic protein complexes.
Biological Reviews. Roč. 98, č. 6 (2023), s. 1910-1927. ISSN 1464-7931. E-ISSN 1469-185X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-11585S; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: Wellcome Trust(GB) 204697/Z/16/Z
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: mitochondrial contact site * cytochrome-c-oxidase * rab gtpase family * respiratory-chain * acanthamoeba-castellanii * trypanosoma-brucei * atp synthase * chlamydomonas-reinhardtii * succinate-dehydrogenase * tethering complexes * molecular evolution * evolutionary mechanisms * gene replacement * constructive neutral evolution * protein complexes * evolutionary divergence
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 11, rok: 2023 ; AIS: 4.557, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/brv.12988
Field, Mark Christian
- Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349356

0604414 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ribeiro, Pedro G. - Butenko, Anzhelika - Linke, Daniel - Ghanavi, H. R. - Meier, J. I. - Wahlberg, N. - Matos Maravi, Pavel F.
Pervasive horizontal transmission of Wolbachia in natural populations of closely related and widespread tropical skipper butterflies.
BMC Microbiology. Roč. 25, č. 1 (2025), č. článku 5. ISSN 1471-2180. E-ISSN 1471-2180
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC22-35084J
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Hesperiidae * Wolbachia * phylogenetics
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.98, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://bmcmicrobiol.biomedcentral.com/counter/pdf/10.1186/s12866-024-03719-1.pdf
Ribeiro, Pedro G.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373224

0560733 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Saura, A. - Zakharova, A. - Klocek, D. - Gerasimov, E.S. - Butenko, Anzhelika - Macedo, D. H. - Servienė, E. - Zagirova, D. - Meshcheryakova, A. - Rogozin, I.B. - Serva, S. - Kostygov, A.Y. - Yurchenko, V.
Elimination of LRVs Elicits Different Responses in Leishmania spp.
mSphere. Roč. 7, AUG (2022), č. článku 4. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Leishmania guyanensis * Leishmania major * lrv1 * lrv2 * capsid
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2022 ; AIS: 1.319, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msphere.00335-22
Kostygov, A.Y.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340279

0558788 - BC 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tashyreva, Daria - Simpson, A.G.B. - Prokopchuk, Galina - Škodová-Sveráková, Ingrid - Butenko, Anzhelika - Hammond, Michael John - George, E.E. - Flegontova, Olga - Záhonová, Kristýna - Faktorová, Drahomíra - Yabuki, A. - Horák, Aleš - Keeling, P.J. - Lukeš, Julius
Diplonemids-A Review on New Flagellates on the Oceanic Block.
Protist. Roč. 173, č. 2 (2022), č. článku 125868. ISSN 1434-4610. E-ISSN 1618-0941
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-23787S; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ambulator larsen * phylogenetic position * microbial eukaryotes * euglena-gracilis * diversity * sea * patterson * protozoa * light * gene * Protists * taxonomic revision * ultrastructure * Euglenozoa * ecology * marine flagellates
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2022 ; AIS: 0.644, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S143446102200013X?via%3Dihub

Tashyreva, Daria Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340424

0644363 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Thakur, Prasoon-Kumar - Butenko, Anzhelika - Karásek, Filip - Svobodová, Michaela - Faktorová, Drahomíra - Pavlisková, Hana - Varga, Vladimír - Horák, Aleš - Lukeš, Julius - Staněk, David
Splice site diversity and abundance of noncanonical introns in diplonemids (Diplonemea, Euglenozoa).
RNA. Roč. 31, č. 12 (2025), s. 1826-1840. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA23-07695S; GA ČR(CZ) GA21-26209S; GA ČR(CZ) GX23-06479X
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:60077344
Klíčová slova: a/b-binding-protein * polyprotein precursor * spliceosome * snRNP * noncanonical introns * euglenozoans * genomics * busco * diplonemids * euglenozoans
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Parasitology (BC-A)
Impakt faktor: 5, rok: 2024 ; AIS: 2.408, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://rnajournal.cshlp.org/content/31/12/1826.full
Staněk, David
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374214

0572381 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Moreira, S. - Petitjean, C. - Benz, Corinna - Butenko, Anzhelika - Flegontova, Olga - Nenarokova, Anna - Prokopchuk, Galina - Batstone, T. - Lapébie, P. - Lemogo, L. - Sarrasin, M. - Stretenowich, P. - Tripathi, Pragya - Yazaki, E. - Nara, T. - Henrissat, B. - Lang, B.F. - Gray, M.W. - Williams, T.A. - Lukeš, Julius - Burger, G.
Recent expansion of metabolic versatility in Diplonema papillatum, the model species of a highly speciose group of marine eukaryotes.
BMC Biology. Roč. 21, č. 1 (2023), č. článku 99. ISSN 1741-7007. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Science
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Paradiplonema papillatum * Protists * Genome * Transcriptome * Proteome * Gene-family evolution * Lateral gene transfer * CAZymes * Feeding strategy * Geographical distribution * Ecological distribution
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2023 ; AIS: 1.909, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-023-01563-9

Valach, M. Burger, G.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344455

0636197 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wiredu-Boakye, D. - Higgins, L. - Gahura, Ondřej - Butenko, Anzhelika - Leonard, G. - Freeman, M. - Kristmundsson, A. - Moore, K. - Harrison, J.W. - Mac Donald, S. - Yurchenko, V. - Williams, B.A.P. - Chahwan, R.
Evolutionary Insights into the Length Variation of DNA Damage Response Proteins Across Eukaryotes.
Genome Biology and Evolution. Roč. 17, č. 6 (2025), č. článku evaf089. ISSN 1759-6653. E-ISSN 1759-6653
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome * expansion * repair * genes * rad51 * microsporidia * requirements * mechanisms * alignment * meiosis * DNA lesions * genome compaction * DNA damage signalling * protein length * intracellular parasites
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 1.197, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/gbe/evaf089

Wiredu-Boakye, D. Chahwan, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373402

0636641 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Füssy, Z. - Albanaz, A.T.S. - Butenko, Anzhelika - Kachale, Ambar - Kraeva, N. - Galan, A. - Zakharova, A. - Stojanova, B. - Votýpka, Jan - Kostygov, A.Y. - Spodareva, V. - Malysheva, M. N. - Frolov, A. O. - Rogozin, I.B. - Paris, Zdeněk - Valášek, Leoš Shivaya - Yurchenko, V. - Lukeš, Julius
Comparative genomic analysis of trypanosomatid protists illuminates an extensive change in the nuclear genetic code.
mBio. Roč. 16, č. 6 (2025), č. článku e0088525. ISSN 2150-7511. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA23-07695S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GF23-08669L
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: transfer-rna genes * divergence times * molecular-basis * evolution * identification * alignment * mutation * erf1 * recognition * insertion * AT-rich genomes * nuclear genetic code * reassigned codon * tRNA structure * eukaryotic release factors * termination of translation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Cell biology (MBU-M)
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.855, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/mbio.00885-25
Yurchenko, V.
- Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368250

0574476 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zakharova, A. - Tashyreva, Daria - Butenko, Anzhelika - Morales, J. - Saura, A. - Svobodová, Michaela - Poschmann, G. - Nandipati, Satish - Zakharova, A. - Noyvert, D. - Gahura, Ondřej - Týč, Jiří - Stuehler, K. - Kostygov, A.Y. - Nowack, E.C.M. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
A neo-functionalized homolog of host transmembrane protein controls localization of bacterial endosymbionts in the trypanosomatid Novymonas esmeraldas.
Current Biology. Roč. 33, č. 13 (2023), s. 2690-+. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Trypanosomatidae * Leishmaniinae * endosymbiosis * Pandoraea * TMEM18
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.1, rok: 2023 ; AIS: 4.385, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982223005420?via%3Dihub
Kostygov, A.Y.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0346008

0561630 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zakharova, A. - Albanaz, A.T.S. - Opperdoes, F. R. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Zagirova, D. - Saura, A. - Chmelova, L. - Gerasimov, E.S. - Leštinová, T. - Bečvář, T. - Sádlová, J. - Volf, P. - Lukeš, Julius - Horváth, A. - Butenko, Anzhelika - Yurchenko, V.
Leishmania guyanensis M4147 as a new LRV1-bearing model parasite: Phosphatidate phosphatase 2-like protein controls cell cycle progression and intracellular lipid content.
PLoS Neglected Tropical Diseases. Roč. 16, č. 6 (2022), č. článku e0010510. ISSN 1935-2735. E-ISSN 1935-2735
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Leishmania guyanensis * progression * intracellular
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022 ; AIS: 1.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosntds/article?id=10.1371/journal.pntd.0010510
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340552