Nápověda

Gahura Ondřej

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 13

0603215 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Abrhámová, K. - Groušlová, M. - Valentová, A. - Hao, X. - Liu, B. - Převorovský, M. - Gahura, Ondřej - Půta, F. - Sunnerhagen, P. - Folk, P.
Truncating the spliceosomal 'rope protein' Prp45 results in Htz1 dependent phenotypes.
RNA biology. Roč. 21, č. 1 (2024), s. 543-559. ISSN 1547-6286. E-ISSN 1555-8584
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: pre-messenger-rna * saccharomyces-cerevisiae * transcription elongation * histone acetylation * h2b ubiquitylation * h3k36 methylation * global analysis * skip interacts * paf1 complex * u2 snrnp * Synthetic genetic array analysis * spliceosome assembly * co-transcriptional splicing * chromatin modifiers * h2a.z
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 1.312, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/15476286.2024.2348896
Folk, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361160

0603909 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Afonin, D.A. - Gerasimov, E. S. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Záhonová, Kristýna - Gahura, Ondřej - Albanaz, A.T.S. - Myšková, Eva - Byková, A. - Paris, Zdeněk - Lukeš, Julius - Opperdoes, F. R. - Horváth, A. - Zimmer, S.L. - Yurchenko, V.
Blastocrithidia nonstop mitochondrial genome and its expression are remarkably insulated from nuclear codon reassignment.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 7 (2024), s. 3870-3885. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S; GA ČR(CZ) GF23-08669L; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: transfer-rna * leishmania-tarentolae * complex-i * phytomonas-serpens * trypanosoma-brucei * minicircle genome * kinetoplast dna * alignment * import * genes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae168
Zimmer, S.L.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361206

0563704 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gahura, Ondřej - Muhleip, A. - Hierro Yap, Carolina - Panicucci, Brian - Jain, Minal - Hollaus, D. - Slapničková, Martina - Zíková, Alena - Amunts, A.
An ancestral interaction module promotes oligomerization in divergent mitochondrial ATP synthases.
Nature Communications. Roč. 13, č. 1 (2022), č. článku 5989. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-17529S; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Mitochondrial * synthase * lineage
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022 ; AIS: 5.767, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-022-33588-z
Zíková, Alena
- Amunts, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339020

0567779 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gahura, Ondřej - Chauhan, Prashant - Zíková, Alena
Mechanisms and players of mitoribosomal biogenesis revealed in trypanosomatids.
Trends in Parasitology. Roč. 38, č. 12 (2022), s. 1053-1067. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: assembly factor * biogenesis * mitochondrial ribosomes * mitoribosomes * Trypanosoma
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 9.6, rok: 2022 ; AIS: 2.593, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471492222001878?via%3Dihub
Gahura, Ondřej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339044

0619441 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gerasimov, E. S. - Afonin, D.A. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Saura, A. - Trusina, N. - Gahura, Ondřej - Zakharova, A. - Butenko, Anzhelika - Baráth, P. - Horváth, A. - Opperdoes, F. R. - Perez-Morga, D. - Zimmer, S.L. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
Evolutionary divergent kinetoplast genome structure and RNA editing patterns in the trypanosomatid Vickermania
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 122, č. 15 (2025), č. článku e2426887122. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S; GA ČR(CZ) GA23-07695S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: minicircle genome * mitochondrial * complex * replication * synthase * organization * Vickermania * RNA editing * trypanosomatids * ATP synthase * kinetoplast DNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 9.1, rok: 2024 ; AIS: 4.117, rok: 2024
Způsob publikování: Open access s časovým embargem
https://doi.org/10.1073/pnas.2426887122
Lukeš, Julius
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367790

0601904 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hashimi, Hassan - Gahura, Ondřej - Pánek, T.
Bringing together but staying apart: decisive differences in animal and fungal mitochondrial inner membrane fusion.
Biological Reviews. Roč. 100, April (2025), s. 920-935. ISSN 1464-7931. E-ISSN 1469-185X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07674S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dynamin-related gtpase * cytochrome-c release * m-aaa protease * respiratory-chain * atp synthase * complex-i * opa1 * cristae * apoptosis * maintenance * apoptosis * cristae * dynamin-related protein * membrane remodelling * mitochondrial dynamics * Mgm1 * Opa1 * phylogeny
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 11.7, rok: 2024 ; AIS: 4.628, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/brv.13168
Hashimi, Hassan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365075

0599352 - FGÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Petr - Čunátová, Kristýna - Kaplanová, Vilma - Puertas-Frias, Guillermo - Šilhavý, Jan - Tauchmannová, Kateřina - Vrbacký, Marek - Čajka, Tomáš - Gahura, Ondřej - Hlaváčková, Markéta - Stránecký, V. - Kmoch, S. - Pravenec, Michal - Houštěk, Josef - Mráček, Tomáš - Pecinová, Alena
Haplotype variability in mitochondrial rRNA predisposes to metabolic syndrome.
Communications Biology. Roč. 7, č. 1 (2024), č. článku 1116. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-10354S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104; GA MŠMT(CZ) LUAUS23095; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Výzkumná infrastruktura: NCMG III - 90267
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: energy metabolism * metabolic syndrome * metabolomics * proteomics
Obor OECD: Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones); Biochemistry and molecular biology (BC-A)
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-024-06819-w
Mráček, Tomáš
- Pecinová, Alena
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356836

0574455 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sheikh, Shaghayegh - Panek, T. - Gahura, Ondřej - Týč, Jiří - Záhonová, Kristýna - Lukeš, Julius - Eliaš, M. - Hashimi, Hassan
A Novel Group of Dynamin-Related Proteins Shared by Eukaryotes and Giant Viruses Is Able to Remodel Mitochondria From Within the Matrix.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 40, č. 6 (2023), č. článku msad134. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA20-23513S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dynamin superfamily * Mgm1 * mitochondria * Nucleocytoviricota * Opa1 * protists
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 11, rok: 2023 ; AIS: 5.284, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/mbe/article/40/6/msad134/7190697?login=true
Eliaš, M.
- Hashimi, Hassan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345920

0574463 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Benz, Corinna - Aguilar, L.C. - Gahura, Ondřej - Faktorová, Drahomíra - Zíková, Alena - Oeffinger, M. - Burger, G. - Gray, M.W. - Lukeš, Julius
Miniature RNAs are embedded in an exceptionally protein-rich mitoribosome via an elaborate assembly pathway.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 12 (2023), s. 6443-6460. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: RNAs * protein-rich mitoribosome
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/12/6443/7173778?login=true

Valach, M. Benz, Corinna
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344803

0636197 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wiredu-Boakye, D. - Higgins, L. - Gahura, Ondřej - Butenko, Anzhelika - Leonard, G. - Freeman, M. - Kristmundsson, A. - Moore, K. - Harrison, J.W. - Mac Donald, S. - Yurchenko, V. - Williams, B.A.P. - Chahwan, R.
Evolutionary Insights into the Length Variation of DNA Damage Response Proteins Across Eukaryotes.
Genome Biology and Evolution. Roč. 17, č. 6 (2025), č. článku evaf089. ISSN 1759-6653. E-ISSN 1759-6653
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome * expansion * repair * genes * rad51 * microsporidia * requirements * mechanisms * alignment * meiosis * DNA lesions * genome compaction * DNA damage signalling * protein length * intracellular parasites
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 1.197, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/gbe/evaf089

Wiredu-Boakye, D. Chahwan, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373402

0574448 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wong, Jonathan - Zíková, Alena - Gahura, Ondřej
The Ancestral Shape of the Access Proton Path of Mitochondrial ATP Synthases Revealed by a Split Subunit-a.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 40, č. 6 (2023), č. článku msad146. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: subunit-a * proton translocation * gene fragmentation * proton path * Trypanosoma brucei * mitochondrial ATP synthase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11, rok: 2023 ; AIS: 5.284, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/40/6/msad146/7203835?login=true
Gahura, Ondřej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344809

0574476 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zakharova, A. - Tashyreva, Daria - Butenko, Anzhelika - Morales, J. - Saura, A. - Svobodová, Michaela - Poschmann, G. - Nandipati, Satish - Zakharova, A. - Noyvert, D. - Gahura, Ondřej - Týč, Jiří - Stuehler, K. - Kostygov, A.Y. - Nowack, E.C.M. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
A neo-functionalized homolog of host transmembrane protein controls localization of bacterial endosymbionts in the trypanosomatid Novymonas esmeraldas.
Current Biology. Roč. 33, č. 13 (2023), s. 2690-+. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Trypanosomatidae * Leishmaniinae * endosymbiosis * Pandoraea * TMEM18
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.1, rok: 2023 ; AIS: 4.385, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982223005420?via%3Dihub
Kostygov, A.Y.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0346008

0640567 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zgadzay, Y. - Mirabello, C. - Wanes, G. - Pánek, T. - Chauhan, Prashant - Nystedt, B. - Zíková, Alena - Whitford, P.C. - Gahura, Ondřej - Amunts, A.
Mettl15-Mettl17 modulates the transition from early to late pre-mitoribosome.
Structure. Roč. 33, č. 10 (2025), s. 1904-1915. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: biogenesis * cryo-EM * methyltransferase * mitochondria * mitoribosome * molecular dynamics * ribosome assembly * translation * Trypanosoma
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
10.1016/j.str.2025.08.002
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370930