Vlček Jakub

0603210 - BÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bohutínská, Magdalena - Petrikova, E. - Booker, T. R. - Vives Cobo, C. - Vlček, Jakub - Šrámková, G. - Poupětová, A. - Hojka, Jakub - Marhold, K. - Yant, L. - Kolář, Filip - Schmickl, Roswitha
Polyploids broadly generate novel haplotypes from trans-specific variation in Arabidopsis arenosa and Arabidopsis lyrata.
PLoS Genetics. Roč. 20, č. 12 (2024), č. článku e1011521. ISSN 1553-7404
Institucionální podpora: RVO:67985939 ; RVO:60077344
Klíčová slova: reproductive isolation * population-structure * genome duplication * speciation * evolution * adaptation * differentiation * endopolyploidy * hybridization
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4, rok: 2023 ; AIS: 2.207, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1011521

Bohutínská, Magdalena Schmickl, Roswitha
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363551

0643688 - BÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Celestini, S. - Lipánová, Veronika - Vlček, Jakub - Kolář, F.
Whole-Genome Duplication Reshapes Adaptation: Autotetraploid Arabidopsis arenosa Leverages its High Genetic Variation to Compensate for Selection Constraints.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 42, č. 12 (2025), č. článku msaf298. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Institucionální podpora: RVO:67985939 ; RVO:60077344
Klíčová slova: adaptive evolution * local adaptation * iron uptake * polyploids evolution * soil adaptation
Obor OECD: Plant sciences, botany; Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology (BC-A)
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 4.312, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/molbev/msaf298

Celestini, S. Kolář, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0375035

0637873 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Nováková, Milena - Vlček, Jakub - Štefka, Jan
Host-Associated Genetic Differentiation in the Face of Ongoing Gene Flow: Ecological Speciation in a Pathogenic Parasite of Freshwater Fish.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 42, č. 7 (2025), č. článku msaf163. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-04676S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ligula-intestinalis cestoda * sympatric speciation * genome scans * r-package * selection * specificity * divergence * signatures * diversity * inference * host-associated genetic differentiation * gene flow * ecological speciation * differential gene expression * sympatric evolution
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 4.312, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/molbev/msaf163
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370279

0567728 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vlček, Jakub - Miláček, Matěj - Vinkler, M. - Štefka, Jan
Effect of population size and selection on Toll-like receptor diversity in populations of Galapagos mockingbirds.
Journal of Evolutionary Biology. Roč. 36, č. 1 (2023), s. 109-120. ISSN 1010-061X. E-ISSN 1420-9101
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: conservation genetics * innate immunity * island birds * molecular phenotype * purifying selection
Obor OECD: Veterinary science
Impakt faktor: 2.1, rok: 2023 ; AIS: 0.782, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jeb.14121

Vlček, Jakub Štefka, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340931

0617668 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vlček, Jakub - Espinoza-Ulloa, S. - Cowles, S.A. - Ortiz-Catedral, L. - Coutu, C. - Chaves, J.A. - Andres, J. - Štefka, Jan
Genomes of Galápagos Mockingbirds Reveal the Impact of Island Size and Past Demography on Inbreeding and Genetic Load in Contemporary Populations.
Molecular Ecology. Roč. 34, č. 5 (2025), č. článku e17665. ISSN 0962-1083. E-ISSN 1365-294X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: galapagos mockingbird * depression * extinction * history * floreana * mutation * differentiation * homozygosity * diversity * framework * conservation genetics * demographic inference * genetic diversity * genetic load
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.536, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/mec.17665
Štefka, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364862

0638194 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vlček, Jakub - Hämälä, T. - Cobo, C.V. - Curran, E. - Šrámková, G. - Slotte, T. - Schmickl, Roswitha - Yant, L. - Kolář, F.
Whole-genome duplication increases genetic diversity and load in outcrossing Arabidopsis arenosa.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 122, č. 31 (2025), č. článku e2501739122. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:67985939
Klíčová slova: mutation load * evolutionary consequences * purifying selection * r-package * fitness * differentiation * populations * impact * accumulation * adaptation * Arabidopsis * evolution * genomics * genetic load * natural selection
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 9.1, rok: 2024 ; AIS: 4.117, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1073/pnas.2501739122
Yant, L.
- Kolář, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373395