Publikace ASEP
0644904 - BC 2026 RIV US eng M - Část monografie knihy
Eyer, Luděk - Svoboda, Pavel - Palus, Martin - Salát, Jiří - Růžek, Daniel
Methods for Evaluation of Antivirals and Neutralizing Antibodies Against Tick-Borne Encephalitis Virus.
Methods in Molecular Biology. Vol. 2936. 1. New York: Humana / Springer Science, 2025 - (Thangamani, S.), s. 125-136. ISBN 978-1-0716-4586-4
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-05-00659
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Antivirals * Immunofluorescence * Monoclonal antibodies * Mouse infection * Neutralization test * Plaque assay * Tick-borne encephalitis virus
Obor OECD: Virology
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1007/978-1-0716-4587-1_14
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374760
0572867 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Eyer, Luděk - Seley-Radtke, K. - Růžek, Daniel
New directions in the experimental therapy of tick-borne encephalitis.
Antiviral Research. Roč. 210, JAN (2023), č. článku 105504. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-05445L; GA ČR(CZ) GA20-14325S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Tick-borne encephalitis * Tick-borne encephalitis virus * Antivirals * Monoclonal antibodies * Immunotherapy
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.276, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S016635422200273X?via%3Dihub
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0343708
0579772 - BC 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Holoubek, Jiří - Salát, Jiří - Kotouček, J. - Kastl, T. - Vancová, Marie - Huvarová, I. - Bednář, P. - Bednářová, Klára - Růžek, Daniel - Renčiuk, Daniel - Eyer, Luděk
Antiviral activity of porphyrins and porphyrin-like compounds against tick-borne encephalitis virus: Blockage of the viral entry/fusion machinery by photosensitization-mediated destruction of the viral envelope.
Antiviral Research. Roč. 221, JAN (2024), č. článku 105767. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-20229S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707
Klíčová slova: Tick-borne encephalitis virus * Porphyrin * Viral envelope * Virus-cell fusion * Photosensitization * Singlet oxygen
Obor OECD: Biophysics; Biophysics (BFU-R)
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 1.082, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166354223002450?via%3Dihub
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355677
0557410 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Holoubek, Jiří - Bednářová, Klára - Haviernik, Jan - Huvarová, I. - Dvořáková, Zuzana - Černý, J. - Outlá, Martina - Salát, Jiří - Konkoľová, Eva - Bouřa, Evžen - Růžek, Daniel - Vorlíčková, Michaela - Eyer, Luděk - Renčiuk, Daniel
Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 8 (2022), s. 4574-4600. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-20229S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: intercalator displacement assay * forming sequences * small-molecule * binding * dna * fluorescence * zika * identification * pyridostatin * inactivation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (BFU-R); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/50/8/4574/6568495?login=true
Eyer, Luděk
- Renčiuk, Daniel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0339132
0638526 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Holoubek, Jiří - Salát, Jiří - Matkovic, M. - Bednář, Petr - Novotný, Pavel - Hradilek, Martin - Majerová, Taťána - Rosendal, E. - Eyer, Luděk - Fořtová, Andrea - Beránková, Michaela - Bell-Sakyi, L. - Överby, A.K. - Cavalli, A. - Bonomi, M. - Rey, F.A. - Růžek, Daniel
Irreversible furin cleavage site exposure renders immature tick-borne flaviviruses fully infectious.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 7491. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07160S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388963
Klíčová slova: flaviviruses * maturation * furin * japanese encephalitis * software news * cell-lines * maturation * dynamics * activation * biology
Obor OECD: Virology; Virology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-62750-6
Rey, F.A.
- Růžek, Daniel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0369305
0574469 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kobayashi, S. - Fukuda, Y. - Yoshii, K. - Thammahakin, P. - Maezono, K. - Eyer, Luděk - Růžek, Daniel - Kariwa, H.
Development of recombinant West Nile virus expressing mCherry reporter protein.
Journal of Virological Methods. Roč. 317, APR (2023), č. článku 114744. ISSN 0166-0934. E-ISSN 1879-0984
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: West Nile virus * Reporter protein * Production of reporter virus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2023 ; AIS: 0.402, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166093423000691?via%3Dihub
Kobayashi, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345586
0557966 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kováčech, B. - Fialova, L. - Filipčík, P. - Skrabana, R. - Zilkova, M. - Paulenka-Ivanovova, N. - Kovac, A. - Palova, D. - Rolkova, G. - Tomková, K. - Csokova, N. - Markova, K. - Skrabanova, M. - Sinska, K. - Basheer, N. - Majerova, P. - Hanes, J. - Parrak, V. - Prcina, M. - Cehlar, O. - Cente, M. - Piešťanský, J. - Fresser, M. - Novak, M. - Slávikova, M. - Borsova, K. - Čabanová, V. - Brejová, B. - Vinař, T. - Nosek, J. - Eyer, Luděk - Hönig, Václav - Palus, Martin - Růžek, Daniel - Vyhlídalová, Tereza - Straková, Petra - Mrázková, Blanka - Zudová, Dagmar - Koubková, Gizela - Novosadová, Vendula - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Žilka, N. - Kontseková, E. … celkem 45 autorů
Monoclonal antibodies targeting two immunodominant epitopes on the Spike protein neutralize emerging SARS-CoV-2 variants of concern.
EBioMedicine. Roč. 76, FEB 2022 (2022), č. článku 103818. ISSN 2352-3964. E-ISSN 2352-3964
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * covid-19 * Neutralizing antibodies * Escape mutation * Variants of concern
Obor OECD: Virology; Virology (UMG-J)
Impakt faktor: 11.1, rok: 2022 ; AIS: 2.586, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235239642200007X?via%3Dihub
Kováčech, B.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0334892
0575506 - BC 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Mariewskaya, K.A. - Gvozdev, D.A. - Chistov, A.A. - Straková, Petra - Huvarová, I. - Svoboda, Pavel - Kotouček, J. - Ivanov, N.M. - Krasilnikov, M.S. - Zhitlov, M.Y. - Pak, A.M. - Mikhnovets, I.E. - Nikitin, T.D. - Korshun, V.A. - Alferova, V.A. - Mašek, J. - Růžek, Daniel - Eyer, Luděk - Ustinov, A.V.
Membrane-targeting perylenylethynylphenols inactivate medically important coronaviruses via the singlet oxygen photogeneration mechanism.
Molecules. Roč. 28, č. 17 (2023), č. článku 6278. ISSN 1420-3049. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: perylene * photosensitizers * antivirals * singlet oxygen * SARS-CoV-2
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2023 ; AIS: 0.677, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1420-3049/28/17/6278
Korshun, V.A.
- Eyer, Luděk
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345266
0605150 - BC 2026 US eng J - Článek v odborném periodiku
Maryewski, X.A. - Krasilnikov, M.S. - Straková, P. - Holoubek, Jiří - Frckova, T. - Panina, I.S. - Krylov, N. A. - Gvozdev, D.A. - Denisov, V.S. - Semenov, A.N. - Lotosh, N.Y. - Selishcheva, A.A. - Chistov, A.A. - Gulyak, E.L. - Kozhemyakin, G.L. - Korshun, V.A. - Efremov, R. G. - Ustinov, A.V. - Růžek, Daniel - Eyer, Luděk - Alferova, V.A.
Membrane-Active Singlet Oxygen Photogenerators as a Paradigm for Broad-Spectrum Antivirals: The Case of Halogenated (BOron)-DIPYrromethenes.
ACS Applied Materials and Interfaces. Roč. 17, č. 3 (2025), s. 4502-4528. ISSN 1944-8244. E-ISSN 1944-8252
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: amphipathic fusion inhibitors * linear constraint solver * hepatitis-c virus * photodynamic therapy * bodipy dyes * force-field * derivatives * reproduction * photosensitizers * fluorescence * enveloped viruses * bodipy * membrane-targetingphotosensitizer * singlet oxygen photogeneration * virus-inactivating activity
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 8.2, rok: 2024 ; AIS: 1.432, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acsami.4c17482
Eyer, Luděk
- Alferova, V.A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362724
0579727 - BC 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Mikhnovets, I.E. - Holoubek, Jiří - Panina, I.S. - Kotouček, J. - Gvozdev, D.A. - Chumakov, S.P. - Krasilnikov, M.S. - Zhitlov, M.Y. - Gulyak, E.L. - Chistov, A.A. - Nikitin, T.D. - Korshun, V.A. - Efremov, R. G. - Alferova, V.A. - Růžek, Daniel - Eyer, Luděk - Ustinov, A.V.
Alkyl Derivatives of Perylene Photosensitizing Antivirals: Towards Understanding the Influence of Lipophilicity.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 24, č. 22 (2023), č. článku 16483. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: amphipathic fusion inhibitors * singlet oxygen generation * charmm force-field * photodynamic therapy * virus * gui * reproduction * dyes * antivirals * perylene * photosensitizers * singlet oxygen * lipophilicity
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2023 ; AIS: 1.055, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/24/22/16483
Ustinov, A.V.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348530
0574490 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Penjarla, S. - Reddy, P.Y. - Penta, S. - Sanghvi, Y.S. - Eyer, Luděk - Štefánik, M. - Růžek, Daniel - Banerjee, S.
Efficient synthesis of novel 2-deoxy-C-nucleosides containing oxa and thiadiazole derivatives and their biological activity.
Journal of Molecular Structure. Roč. 1292, NOV (2023), č. článku 136099. ISSN 0022-2860. E-ISSN 1872-8014
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18016
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Cnucleoside * Oxadiazoles * Thiadiazoles * Antiviral * Antitumor * Heterocycles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4, rok: 2023 ; AIS: 0.385, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022286023011924?via%3Dihub
Banerjee, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345916
0582961 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Penjarla, S. - Reddy, P.Y. - Penta, S. - Sanghvi, Y.S. - Eyer, Luděk - Štefánik, M. - Krátká, Z. - Růžek, Daniel - Banerjee, S.
Synthesis and Antiviral Activity of 2′-Modified L-Nucleoside Analogues.
ChemistrySelect. Roč. 8, č. 48 (2023), č. článku e202303585. ISSN 2365-6549. E-ISSN 2365-6549
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18016
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: scale synthesis * pyrimidine * uridine * Antiviral Agent * L-2, 2'-anhydrouridine * L-Arabinose * Cytotoxicity * L-Nucleoside
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 1.9, rok: 2023 ; AIS: 0.269, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/slct.202303585
Penta, S.
- Banerjee, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351001
0574493 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Straková, Petra - Bednář, Petr - Kotouček, J. - Holoubek, Jiří - Fořtová, A. - Svoboda, Pavel - Štefánik, M. - Huvarová, I. - Šimečková, P. - Mašek, J. - Gvozdev, D.A. - Mikhnovets, I.E. - Chistov, A.A. - Nikitin, T.D. - Krasilnikov, M.S. - Ustinov, A. - Alferova, V.A. - Korshun, V.A. - Růžek, Daniel - Eyer, Luděk
Antiviral activity of singlet oxygen-photogenerating perylene compounds against SARS-CoV-2: Interaction with the viral envelope and photodynamic virion inactivation.
Virus Research. Roč. 334, SEPT (2023), č. článku 199158. ISSN 0168-1702. E-ISSN 1872-7492
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * Perylene-related compound * Antiviral activity * Membrane * Liposome * Photodynamic inactivation
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2023 ; AIS: 0.679, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S016817022300120X?via%3Dihub
Eyer, Luděk
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345239
0555514 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Štefánik, M. - Bhosale, D. - Haviernik, Jan - Straková, Petra - Fojtiková, M. - Dufková, L. - Huvarová, I. - Salát, J. - Bartáček, J. - Svoboda, J. - Sedlák, M. - Růžek, Daniel - Miller, A. - Eyer, Luděk
Diphyllin Shows a Broad-Spectrum Antiviral Activity against Multiple Medically Important Enveloped RNA and DNA Viruses.
Viruses. Roč. 14, č. 2 (2022), č. článku 354. ISSN 1999-4915. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18016
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: v-atpase inhibitor * lignans * glycosides * cells * arylnaphthalene * enveloped virus * diphyllin * cleistanthin B * vacuolar ATPase inhibitor * antiviral activity * cytotoxicity
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2022 ; AIS: 1.096, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/14/2/354
Miller, A.
- Eyer, Luděk
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340396
0569226 - BC 2023 RIV US eng M - Část monografie knihy
Thames, J. E. - Eyer, Luděk - Seley-Radtke, K.
Small molecule-based inhibitors for treatment of tick-borne encephalitis virus infection: Nucleoside analogs and nonnucleoside antivirals.
Annual Reports in Medicinal Chemistry. Cham: Springer, 2022 - (Neidle, S.), Roč. 58 (2022), s. 55-92. ISBN 9780323988933
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18016
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Nonnucleoside inhibitor * Nucleoside analog * Small molecule-based inhibitor * Tick-borne encephalitis * Tick-borne encephalitis virus
Obor OECD: Microbiology
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0065774322000033?pes=vor
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340607
0599653 - ÚEB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Turečková, Veronika - Oklešťková, Jana - Žukauskaitė, A. - Eyer, Luděk - Novák, Ondřej - Strnad, Miroslav
A New Abscisic Acid Conjugate, ABA-L-Glutamate, Determined in Different Plant Species by Combined Immunoaffinity Chromatography-Tandem Mass Spectrometry.
Journal of Plant Growth Regulation. Roč. 43, 21 Aug (2024), s. 4810-4825. ISSN 0721-7595. E-ISSN 1435-8107
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:60077344
Klíčová slova: performance liquid-chromatography * solid-phase extraction * signal-transduction * auxin * metabolites * enzyme * purification * immunoassay * radioimmunoassay * biosynthesis * Abscisic acid amino acid conjugate (ABA-AA) * Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) * Monoclonal antibody (mAb) * Immunoaffinity chromatography (IAC) * Ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) * Tandem mass spectrometry (MS/MS)
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 4.4, rok: 2024 ; AIS: 0.669, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00344-024-11436-2
Turečková, Veronika
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357101
0604841 - BC 2025 RIV NZ eng J - Článek v odborném periodiku
Vojníková, M. - Sukupova, M. - Štefánik, M. - Straková, Petra - Haviernik, J. - Kapolkova, K. - Gruberova, E. - Rašková, K. - Michalkova, H. - Švec, P. - Kudlickova, M.P. - Huvarová, I. - Růžek, Daniel - Salát, Jiří - Pekařík, V. - Eyer, Luděk - Heger, Z.
Nanoformulation of the Broad-Spectrum Hydrophobic Antiviral Vacuolar ATPase Inhibitor Diphyllin in Human Recombinant H-ferritin.
International Journal of Nanomedicine. Roč. 19, APR (2024), s. 3907-3917. ISSN 1178-2013. E-ISSN 1178-2013
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: delivery * apoferritin * nanoparticles * nanocage * channels * agents * drug delivery * SARS-CoV-2 * tbev * wnv * Zika virus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 6.5, rok: 2024 ; AIS: 1.141, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.2147/IJN.S452119
Heger, Z.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362352