0616627 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Boukheloua, Roudaina - Mukherjee, Indranil - Park, Hongjae - Šimek, Karel - Kasalický, Vojtěch - Ngochera, M. - Grossart, H.P. - Picazo-Mozo, A. - Camacho, A. - Cabello-Yeves, P.J. - Rodriguez-Valera, F. - Callieri, C. - Andrei, A.S. - Pernthaler, J. - Posch, T. - Alfreider, A. - Sommaruga, R. - Hahn, M.W. - Sonntag, B. - López-García, P. - Moreira, D. - Jardillier, L. - Lepere, C. - Biderre-Petit, C. - Bednarska, A. - Slusarczyk, C. - Toth, V. R. - Banciu, H.L. - Kormas, K. - Orlic, S. - Šantić, D. - Muyzer, G. - Herlemann, D.P.R. - Tammert, H. - Bertilsson, S. - Langenheder, S. - Zechmeister, T. - Salmaso, N. - Storelli, N. - Capelli, C. - Lepori, F. - Lanta, Vojtěch - Vieira, Helena Henriques - Kostanjšek, Fran - Kabeláčová, Kateřina - Chiriac, Maria-Cecilia - Haber, Markus - Shabarova, Tatiana - Fernandes, Clafy - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Szoke-Nagy, Tiberiu - Layoun, Paul - Wong, Hon Lun - Kavagutti, Vinicius Silva - Bulzu, Paul-Adrian - Salcher, Michaela M. - Piwosz, K. - Ghai, Rohit
Global freshwater distribution of Telonemia protists.
The ISME Journal. Roč. 18, č. 1 (2024), č. článku wrae177. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR GF22-35826K; GA ČR GA22-03662S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:67985939
Klíčová slova: multiple sequence alignment * river estuary * coastal site * metagenomics
Obor OECD: Microbiology; Ecology (BU-J)
Impakt faktor: 10, rok: 2024 ; AIS: 3.632, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1093/ismejo/wrae177
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363612

0558631 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Chiriac, Maria-Cecilia - Bulzu, Paul-Adrian - Andrei, A.S. - Okazaki, Y. - Nakano, S. - Haber, Markus - Kavagutti, Vinicius Silva - Layoun, Paul - Ghai, Rohit - Salcher, Michaela M.
Ecogenomics sheds light on diverse lifestyle strategies in freshwater CPR.
Microbiome. Roč. 10, č. 1 (2022), č. článku 84. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * in-situ hybridization * ribosomal-rna * protein secretion * database * genome * identification * bacteria * symbionts * resource * Patescibacteria * cpr * Freshwater lakes * Metagenomics * Genome reduction * Metabolism * Lifestyle * card-fish
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022 ; AIS: 4.656, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01274-3
Chiriac, Maria-Cecilia
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340290

0583806 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kavagutti, Vinicius Silva - Chiriac, Maria-Cecilia - Ghai, Rohit - Salcher, Michaela M. - Haber, Markus
Isolation of phages infecting the abundant freshwater Actinobacteriota order 'Ca. Nanopelagicales'.
The ISME Journal. Roč. 17, č. 6 (2023), s. 943-946. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA23-06806S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protein * genomes * phages
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 10.8, rok: 2023 ; AIS: 3.488, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41396-023-01400-5
Haber, Markus
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351805

0583913 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ngugi, D.K. - Salcher, Michaela M. - Andrei, A.S. - Ghai, Rohit - Klotz, F. - Chiriac, Maria-Cecilia - Ionescu, D. - Buesing, P. - Grossart, H.P. - Xing, P. - Priscu, J. C. - Alymkulov, S. - Pester, M.
Postglacial adaptations enabled colonization and quasi-clonal dispersal of ammonia-oxidizing archaea in modern European large lakes.
Science Advances. Roč. 9, č. 5 (2023), č. článku eadc9392. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * phylogenetic reconstruction * sulfolobus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11.7, rok: 2023 ; AIS: 5.093, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1126/sciadv.adc9392
Ngugi, D.K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351891

0583665 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Mukherjee, Indranil - Szoke-Nagy, Tiberiu - Haber, Markus - Salcher, Michaela M. - Ghai, Rohit
Cryptic and ubiquitous aplastidic cryptophytes are key freshwater flagellated bacterivores.
The ISME Journal. Roč. 17, č. 1 (2023), s. 84-94. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR GF22-35826K; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protists * sequence * marine * cryptomonas * paramecium
Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impakt faktor: 10.8, rok: 2023 ; AIS: 3.488, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41396-022-01326-4
Šimek, Karel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351690

0585489 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Villena-Alemany, Cristian - Mujakić, Izabela - Fecskeová, L. K. - Woodhouse, J. - Auladell, A. - Dean, Jason Lawrence - Hanusová, Martina - Socha, M. - Gazulla, C. R. - Ruscheweyh, H. - Sunagawa, S. - Kavagutti, V. S. - Andrei, A. - Grossart, H. - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal - Piwosz, Kasia
Phenology and ecological role of aerobic anoxygenic phototrophs in freshwaters.
Microbiome. Roč. 12, č. 1 (2024), č. článku 65. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: semi-micro determination * peg-model * diversity * bacteria * gene * growth * populations * evolution * atlantic * database * Freshwaters * Aquatic microbial ecology * Microbial seasonal succession * Long-term sampling * Aerobic anoxygenic phototrophs * pufM gene * PEG model * Photoheterotrophs
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 12.7, rok: 2024 ; AIS: 4.38, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01786-0

Villena-Alemany, Cristian Piwosz, Kasia
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353176