Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

0644832 - ÚOCHB 2027 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Špirko, Vladimír
On the Elusive Ninth Vibrational State of the Argon Dimer.
Natural Sciences. Roč. 6, č. 1 (2026), č. článku e70046. ISSN 2698-6248. E-ISSN 2698-6248
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: argon dimer * binding energy * reduced potential * scattering length
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 1.054, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
10.1002/ntls.70046
Špirko, Vladimír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374706

0604703 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Štaflová, Karolína - Zábranský, Aleš - Pichová, Iva
Evaluation of the role of unconventional prefoldin RPB5 interactor (URI1) in hepatitis B virus infection.
Virology Journal. Roč. 22, January (2025), č. článku 7. ISSN 1743-422X. E-ISSN 1743-422X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: unconventional prefoldin RPB5 interactor * URI1 * hepatitis B virus * HBV * hepatocellular carcinoma
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.853, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12985-024-02617-2
Pichová, Iva
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362292

0641862 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Štaflová, Karolína - Clarová, Kamila - Doležal, Michal - Hubálek, Martin - Křenková, Alena - Hodek, Jan - Pichová, Iva - Zábranský, Aleš
Hepatitis B virus is a stealth virus that minimizes proteomic and secretomic changes in primary human hepatocytes.
Journal of General Virology. Roč. 106, č. 11 (2025), č. článku 002170. ISSN 0022-1317. E-ISSN 1465-2099
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: bulevirtide * hepatitis B virus * host factor * proteomics * reticulocalbin-2 * secretome * virus–host interaction
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.975, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1099/jgv.0.002170
Pichová, Iva
- Zábranský, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371877

0600209 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Šťastný, D. - Balleková, Alena - Tahotná, D. - Pokorná, L. - Holič, R. - Humpolíčková, Jana - Griač, P.
Characterization of two Plasmodium falciparum lipid transfer proteins of the Sec14/CRAL-TRIO family.
Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids. Roč. 1870, č. 1 (2025), č. článku 159572. ISSN 1388-1981. E-ISSN 1879-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-27735K
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: malaria * Plasmodium falciparum * Saccharomyces cerevisiae * lipid transfer proteins * phospholipids * sterols
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2024 ; AIS: 1.056, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bbalip.2024.159572
Griač, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357562

0644936 - ÚOCHB 2027 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Štefek, Milan - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Nencka, Radim
C7-Sulfonamide functionalization of 7-deazaadenosines: sangivamycin analogues with Haspin inhibitory activity.
Chemical Communications. (2026), č. článku 9610838. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: potential purine antagonists * in-vivo antitumor * nucleoside analog
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.775, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D5CC06746D
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374770

0639710 - ÚMG 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Štefela, A. - Dohnalová, Klára - Laštůvková, H. - Škoda, J. - Bajnoková, M. - Lestavel, S. - Touche, V. - Kašpar, Miroslav - Kudová, Eva - Hroch, M. - Mičuda, S. - Kučera, O. - Pávek, P.
The farnesoid X receptor (FXR) antagonist 7(3-isopropylchenodeoxycholic acid improves glucose metabolism in mice on a Western diet.
Pharmacological Research. Roč. 221, November (2025), č. článku 107950. ISSN 1043-6618. E-ISSN 1096-1186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388963
Klíčová slova: farnesoid X receptor antagonist * TGR5 * glucagon-like peptide 1 * glucose transporters
Impakt faktor: 10.5, rok: 2024 ; AIS: 2.014, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.phrs.2025.107950
Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374915

0603177 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Štěpánek, O. - Parigger, M. - Procházková, Eliška - Čmoková, Adéla - Kolařík, Miroslav - Dračínská, H. - Černá, V. - Kalíková, K. - Grobárová, V. - Černý, J. - Scheler, J. - Schweiger, G. - Binder, U. - Baszczyňski, Ondřej
Prodrugging fungicidal amphotericin B significantly decreases its toxic effects.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 283, February (2025), č. článku 117157. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
AV ČR(CZ) StrategieAV21/33
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: antifungal * amphotericin * prodrugs * toxicity * Galleria mellonella * Candida albicans * Aspergillus fumigatus * fungal infection
Obor OECD: Organic chemistry; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 0.998, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2024.117157
Binder, U.
- Baszczyňski, Ondřej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360413

0638117 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Štěpánová, Sille - Kašička, Václav
Separation and analysis of proteins by capillary electromigration methods in the period mid-2021–2024.
Analytica Chimica Acta. Roč. 1368, September (2025), č. článku 344323. ISSN 0003-2670. E-ISSN 1873-4324
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: affinity electrophoresis * capillary electrophoresis * isoelectric focusing * isotachophoresis * peptides * review
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 6, rok: 2024 ; AIS: 0.84, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.aca.2025.344323
Kašička, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368852

0637126 - ÚŽFG 2026 RIV NZ eng J - Článek v odborném periodiku
Šuca, H. - Juhás, Štefan - Juhásová, Jana - Jenčová, V. - Kuželová Košťáková, E. - Lukáš, D. - Bohuš, P. - Ballová, Z. - Zajíček, R. - Rejman, Dominik - Gál, P.
Validation of Lipophosphonoxin-loaded Polycaprolactone Nanofiber Dressing for Full-thickness Wounds in a Porcine Model.
In Vivo. Roč. 39, č. 3 (2025), s. 1331-1340. ISSN 0258-851X. E-ISSN 1791-7549
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004562; GA ČR(CZ) GA22-08857S; GA MZd(CZ) NW24-08-00073; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:67985904 ; RVO:61388963
Klíčová slova: wound healing * active wound dressing * wound treatment
Obor OECD: Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)
Impakt faktor: 1.8, rok: 2024 ; AIS: 0.401, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://iv.iiarjournals.org/content/39/3/1331
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368047

0619146 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šulc, Josef - Vondrášek, Jiří
Unraveling the Tether: Exploring Representative Protein Linkers and Their Structural and Thermodynamical Properties.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 129, č. 15 (2025), s. 3720-3730. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: free energy * dynamics * entropies
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.9, rok: 2024 ; AIS: 0.663, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c04194
Vondrášek, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365873

0635644 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tekel, Andrej - Orságh, Martin - Dračínský, Martin - Pluskal, Tomáš
Bacterial Fluorinase FIA1 and Evolutionarily Related, Lysine-free StDUF62 Show Distinct Diastereoselectivity and Salt Sensitivity.
ACS Omega. Roč. 10, č. 20 (2025), s. 20509-20514. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-11563M
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: adenosyl-l-methionine * S-adenosylmethionine * protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsomega.5c00855
Pluskal, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366676

0635720 - ÚOCHB 2026 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Tenora, Lukáš
Renezance 6-diazo-5-oxo-ʟ-norleucinu (DON): Strategie proléčiv jako možná cesta k novému protinádorovému léčivu.
[Renaissance of 6-Diazo-5-oxo-ʟ-norleucine (DON): Prodrug Strategy as a Promising Tool Leading to Potential Anticancer Drug.]
Chemické listy. Roč. 119, č. 5 (2025), s. 274-286. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 6-diazo-5-oxo-ʟ-norleucine * natural substance * prodrugs * anticancer drugs * sirpiglenastat
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 0.4, rok: 2024 ; AIS: 0.022, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.54779/chl20250274
Tenora, Lukáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366752

0635509 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Théron, B. - Vlk, L. - Chlupatý, T. - Penouilh, M. J. - Procházková, Eliška - Malacea-Kabbara, R. - Le Gendre, P. - Růžička, A.
Flexible Biguanide Mono- and Bimetallic Zinc Complexes for the Ring-Opening (Co)polymerization of Lactides.
ACS Catalysis. Roč. 15, č. 11 (2025), s. 9117-9129. ISSN 2155-5435. E-ISSN 2155-5435
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: biguanide * zinc * ROP * copolymer * immortal polymerization
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 2.827, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acscatal.5c01335
Chlupatý, T.
- Le Gendre, P.
- Růžička, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366579

0638304 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tichý, David - Černý, Tomáš - Filgas, Josef - Voltrová, Svatava - Klepetářová, Blanka - Beier, Petr
Synthesis of 1-Fluoroalkyl-5-Substituted-1,2,3-Triazoles from Carbonyl-Stabilized Phosphonium Ylides.
Journal of Organic Chemistry. Roč. 90, č. 33 (2025), s. 11838-11843. ISSN 0022-3263. E-ISSN 1520-6904
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04659S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: azide-alkyne cycloaddition * high-yielding synthesis * 1,5-disubstituted 1,2,3-triazoles
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.566, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.joc.5c01055
Beier, Petr
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369015

0618038 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tsalyy, Artem - Král, Michal - Reiberger, Róbert - Majer, Pavel - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan - Machara, Aleš
Design, synthesis, and activity evaluation of C-8 arylated luteolin derivatives as influenza endonuclease inhibitors.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 121, June (2025), č. článku 130178. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: influenza * endonuclease * flavonoid * inhibitors * RNA polymerase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2025.130178
Kožíšek, Milan
- Machara, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364870

0619854 - FZÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tufani, A. - Popov, N. - Kovač, J. - Čampelj, S. - Mavrič, A. - Landovský, Tomáš - Cigl, Martin - Vaňkátová, Petra - Loula, Martin - Novotná, Vladimíra - Poberznik, M. - Herrero-Saboya, G. - Martin-Samos, L. - Mertelj, A. - Lisjak, D.
Nonconductive ferrofluids from permanently magnetic nanoplatelets hybridized with polar phosphonic ligands.
Dalton Transactions. Roč. 54, č. 19 (2025), s. 7906-7922. ISSN 1477-9226. E-ISSN 1477-9234
GRANT EU: European Commission(XE) 899285 - MAGNELIQ
Institucionální podpora: RVO:68378271 ; RVO:61388963
Klíčová slova: ferrofluids * ferromagnetic liquid state
Obor OECD: Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.); Analytical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2024 ; AIS: 0.477, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Lisjak, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368943

0637864 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Unno, M. - Morikawa, M. - Sychrovský, Vladimír - Koga, M. - Minowa, N. - Komuro, S. - Shimizu, M. - Fukuta, M. - Tsuyuguchi, F. - Mano, H. - Ochi, Y. - Nakashima, K. - Okamoto, Y. - Saio, T. - Hattori, Y. - Tanaka, Y.
Capturing a glycosylase reaction intermediate in DNA repair by freeze-trapping of a pH-responsive hOGG1 mutant.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 14 (2025), č. článku gkaf718. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA repair * hOGG1
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf718

Unno, M. Hattori, Y.
- Tanaka, Y.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368661

0643383 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vacek ml., Jaroslav - Vrška, Dávid - Manna, Debashree - Lo, Rabindranath - Hobza, Pavel
Solvation strategies for free-energy calculations in a halogen-bonded complex: implicit, explicit, and machine learning approaches.
Chemical Science. Roč. 16, č. 48 (2025), s. 23129-23138. ISSN 2041-6520. E-ISSN 2041-6539
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics * solvent * exchange
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 7.4, rok: 2024 ; AIS: 1.819, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D5SC06336A
Manna, Debashree
- Lo, Rabindranath
- Hobza, Pavel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373378

0619557 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vala, D. - Zdráhala, Jiří - Hudecová, J. - Šestáková, Hana - Šebestík, Jaroslav - Kopečný, D. - Kapitán, J. - Bouř, Petr - Postava, K.
Mueller matrix polarimetry reveals chiroptical properties of metal chelates in solutions.
Spectrochimica Acta Part A-Molecular and Biomolecular Spectroscopy. Roč. 339, October (2025), č. článku 126279. ISSN 1386-1425. E-ISSN 1873-3557
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-33060S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Mueller matrix polarimetry * density functional theory * circular dichroism * transition metal complexes * near-infrared spectroscopy * Kramers-Kronig transformation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 0.55, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.saa.2025.126279

Vala, D. Bouř, Petr
- Postava, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366222

0605347 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valenstein, M. L. - Lalgudi, P. V. - Kedir, J. F. - Condon, K. J. - Platzek, A. - Freund, D. G. - Taylor, M. S. - Xu, Y. - Chivukula, R. R. - Sabatini, David M.
Amino acids and KLHL22 do not activate mTORC1 via DEPDC5 degradation.
Nature. Roč. 637, č. 8045 (2025), E11-E14. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Institucionální podpora: RVO:61388963
Impakt faktor: 48.5, rok: 2024 ; AIS: 23.37, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1038/s41586-024-07974-0
Valenstein, M. L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363127

0639789 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valenstein, M. L. - Wranik, M. - Lalgudi, P. V. - Linde-Garelli, K. Y. - Choi, Y. - Chivukula, R. R. - Sabatini, David M. - Rogala, K. B.
Structural basis for the dynamic regulation of mTORC1 by amino acids.
Nature. Roč. 646, č. 8084 (2025), s. 493-500. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: beam-induced motion * cryo-EM structure * tumor suppressor
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 48.5, rok: 2024 ; AIS: 23.37, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41586-025-09428-7
Sabatini, David M.
- Rogala, K. B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370223

0617958 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valeros, J. - Jerome, M. - Tseyang, T. - Vo, P. - Do, T. - Palomino, D. F. - Grotehans, N. - Kunala, M. - Jerrett, A. E. - Hathiramani, N. R. - Mireku, M. - Magesh, R. Y. - Yenilmez, B. - Rosen, P. C. - Mann, J. L. - Myers, J. W. - Kunchok, T. - Manning, T. L. - Boercker, L. N. - Carr, P. E. - Bin Munim, M. - Lewis, C. A. - Sabatini, David M. - Kelly, M. - Xie, J. - Czech, M. P. - Gao, G. - Shepherd, J. N. - Walker, A. K. - Kim, H. - Watson, E. V. - Spinelli, J. B.
Rhodoquinone carries electrons in the mammalian electron transport chain.
Cell. Roč. 188, č. 4 (2025), s. 1084-1099. ISSN 0092-8674. E-ISSN 1097-4172
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: coenzyme Q * mitochondria * oxygen
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 42.5, rok: 2024 ; AIS: 23.605, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.12.007
Spinelli, J. B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364783

0641010 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Van Den Bossche, T. - Alexandrov, T. - Bilbao, A. - Bittremieux, W. - Brigante, Federico Ivan - Chambers, M. C. - Charkow, J. - Deutsch, E. - Dowsey, A. W. - El Abiead, Y. - Gabriels, R. - Hecht, H. - Heuckeroth, S. - Klein, J. A. - Knierman, M. - Martens, L. - Moritz, R. L. - McCall, L. I. - Neumann, S. - Perez-Riverol, Y. - Röst, H. L. - Price, E. J. - Shofstahl, J. - Tabb, D. L. - Uszkoreit, J. - Vizcaíno, J. A. - Wang, M. - Willems, S. - Winkelhardt, D. - Kohlbacher, O. - Wein, S. P.
mzPeak: Designing a Scalable, Interoperable, and Future-Ready Mass Spectrometry Data Format.
Journal of Proteome Research. Roč. 24, č. 11 (2025), s. 5329-5335. ISSN 1535-3893. E-ISSN 1535-3907
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: mass spectrometry * standards * data formats * proteomics * metabolomics * lipidomics * proteomics standards initiative
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.223, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.5c00435
Kohlbacher, O.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371239

0640344 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková, E. - Obrová, K. - Hodek, Jan - Machková, A. - Kašparová, P. - Khun, J. - Lokajová, E. - Ulrychová, Lucie - Fürhacker, P. - Sláma, M. - Přikryl, R. - Kalina, L. - Krobot, Š. - Lion, T. - Weber, Jan - Scholtz, V.
Scaled-up non-thermal plasma-generating device Plasmatico enables effective and harmless disinfection of personal protective equipment.
Scientific Reports. Roč. 15, October (2025), č. článku 35631. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cold atmospheric plasma * disinfection * MRSA * SARS-CoV-2 * virus inactivation
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-025-19520-7
Vaňková, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370746

0644528 - ÚOCHB 2027 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vetýšková, Veronika - Kašparová, P. - Bednárová, Lucie - Hájek, Miroslav - Luxa, J. - Bautista, A. B. - Reseland, J. E. - Maťátková, O. - Masák, J. - Vondrášek, Jiří - Vydra Boušová, Kristýna
Antimicrobial peptides derived from human ameloblastin targeting biofilms.
BMC Oral Health. Roč. 26, č. 24 (2026), č. článku 24. ISSN 1472-6831. E-ISSN 1472-6831
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ameloblastin * antimicrobial peptides * bacterial biofilm * tooth enamel * IDP
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.666, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12903-025-07433-w
Vondrášek, Jiří
- Vydra Boušová, Kristýna
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374349

0605433 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Vijayalakshmi, P. - Gowdham, M. - Dinesh, Dhurvas Chandrasekaran - Sibiya, A. - Vaseeharan, B. - Selvaraj, C.
Unveiling the guardians of the genome: The dynamic role of histones in DNA organization and disease.
Nuclear Proteins. London: Academic Press, 2025, s. 39-68. Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, 143. ISBN 978-0-443-29564-5
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: chromatin * disease * gene expression * genomic stability * histones * nucleosomes * post-translational modifications (PTMs)
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/bs.apcsb.2024.08.001
Selvaraj, C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363147

0637824 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vitale, G. A. - Xia, S. N. - Dührkop, K. - Zare Shahneh, M. R. - Brötz-Oesterhelt, H. - Mast, Y. - Brungs, Corinna - Böcker, S. - Schmid, Robin - Wang, M. - Hughes, C. C. - Petras, D.
Enhancing tandem mass spectrometry-based metabolite annotation with online chemical labeling.
Nature Communications. Roč. 16, July (2025), č. článku 6911. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: derivatization * inhibitors
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-61240-z
Hughes, C. C.
- Petras, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368634

0604323 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vitek, Marco - Deng, J. R. - Anderson, H. L. - Rončević, I.
Global Aromatic Ring Currents in Neutral Porphyrin Nanobelts.
ACS Nano. Roč. 19, č. 1 (2025), s. 1405-1411. ISSN 1936-0851. E-ISSN 1936-086X
Grant CEP: GA ČR GA24-10982S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ring current * aromaticity * density functional theory * porphyrin nanobelts * molecular electronics
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 16, rok: 2024 ; AIS: 3.306, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsnano.4c14100
Rončević, I.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361705

0619790 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vitek, Marco - Rončević, Igor - Maršálek, O. - Schewe, Hanns Christian - Jungwirth, Pavel
Rapid flipping between electrolyte and metallic states in ammonia solutions of alkali metals.
Nature Communications. Roč. 16, May (2025), č. článku 4302. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR GA24-10982S
GRANT EU: European Commission(XE) 101095957 - Q-SCALING
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: generalized gradient approximation * total-energy calculations * nonmetal transition
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-59071-z
Maršálek, O.
- Schewe, Hanns Christian
- Jungwirth, Pavel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366435

0603262 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vlk, Mikuláš - Wan, J. - Nytka, M. - Kim Vu, T. N. - Lemr, Karel - Tureček, F.
Photochemical and Collision-Induced Cross-Linking of Asp, Glu, Asn, and Gln Residues in Peptide-Nitrile Imine Conjugate Ions in the Gas Phase.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry. Roč. 36, č. 1 (2025), s. 175-186. ISSN 1044-0305. E-ISSN 1879-1123
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: mass spectrometry * peptide * crosslinking
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 2.7, rok: 2024 ; AIS: 0.674, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/jasms.4c00394
Lemr, Karel
- Tureček, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360470

0639544 - MBÚ 2026 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Vopálenská, Andrea - Balogová, Soňa - Hovorková, Michaela - Vrbata, David - Červený, Jakub - Petrásková, Lucie - Pelantová, Helena - Nekvasilová, Pavlína - Slámová, Kristýna - Cvačka, Josef - Shaliutina-Loginova, Anna - Křen, Vladimír - Bojarová, Pavla
Targeting galectin-4 with glycoconjugates of varying architectures: a multivalency etude with accent on anti-tumor effect and protection against apoptosis.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 300, 15 Dec (2025), č. článku 118149. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597; GA MŠMT(CZ) LUC24024; GA ČR(CZ) GF22-00197K
GRANT EU: European Commission(CZ) CA22103
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Apoptosis * Cancer * Carbohydrate * Galectin-4 * Glycopolymer * Multivalency * Polyoxazoline
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Analytical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 0.998, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0223523425009146?via%3Dihub
Bojarová, Pavla
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369978

0617392 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vopálenský, Pavel - Škríba, Anton - Chiumenti, M. - Ďuričeková, Lucia - Šimonová, Anna - Lukšan, Ondřej - Di Serio, F. - Navarro, B. - Cahová, Hana
Exploring RNA modifications in infectious non-coding circular RNAs.
RNA biology. Roč. 22, č. 1 (2025), s. 1-9. ISSN 1547-6286. E-ISSN 1555-8584
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 101041374 - StressRNaction
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: viroid * RNA modification * 6-methyladenosine * direct RNA-seq * LC-MS, m6A SELECT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 1.312, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/15476286.2025.2459039
Navarro, B.
- Cahová, Hana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364327

0641713 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vorontsov, I. E. - Kozin, I. - Abramov, S. - Boytsov, A. - Jolma, A. - Albu, M. - Ambrosini, G. - Faltejsková, Kateřina - Gralak, A. J. - Gryzunov, N. - Inukai, S. - Kolmykov, S. - Kravchenko, P. - Kribelbauer-Swietek, J. F. - Laverty, K. U. - Nozdrin, V. - Patel, Z. M. - Penzar, D. - Plescher, M. L. - Pour, S. E. - Razavi, R. - Yang, A. W. H. - Yevshin, I. - Zinkevich, A. - Weirauch, M. T. … celkem 34 autorů
Cross-platform motif discovery and benchmarking to explore binding specificities of poorly studied human transcription factors.
Communications Biology. Roč. 8, November (2025), č. článku 1545. E-ISSN 2399-3642
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: sites * collection * HOCOMOCO
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-025-08909-9
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371768

0644693 - ÚOCHB 2027 RIV CH eng B - Monografie kniha jako celek
Vrábel, Milan - Mikula, H.
Bioorthogonal Reactions. Advances and Applications in Chemical Biology and Biomedicine.
Cham: Springer Cham, 2026. 352 s. Topics in Current Chemistry Collections. ISBN 978-3-032-09820-7
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: click chemistry * bioconjugations * cycloadditions * bioorthogonal reactions * chemical biology
https://doi.org/10.1007/978-3-032-09821-4
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374559

DOI

0619190 - ÚACH 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vrána, J. - Holub, Josef - Samsonov, M. A. - Růžičková, Z. - Bulánek, R. - Fanfrlík, Jindřich - Hnyk, Drahomír - Gomila, R.M. - Frontera, A. - Růžička, A.
Phenyl-Substituted Thiaboranes-Linked 2D and 3D Aromatics as Noncovalent Organic Framework Materials.
Inorganic Chemistry. Roč. 64, č. 15 (2025), s. 7377-7387. ISSN 0020-1669. E-ISSN 1520-510X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-03945S
Institucionální podpora: RVO:61388980 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Cavities * Inorganic carbon compounds * Materials * Molecules * Supramolecular chemistry * CO2 capture
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry; Physical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.668, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Růžička, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365927

0644641 - ÚOCHB 2027 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vrkoslav, Vladimír - Pražáková, Kateřina - Strnad, Štěpán - Paukner, K. - Muffová, B. - Kauerová, S. - Sýkora, D. - Cvačka, Josef - Poledne, R. - Petráš, M. - Králová Lesná, I.
Lipidomics of polarized macrophages in the human adipose tissue.
Scientific Reports. Roč. 16, December (2026), č. článku 3018. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: adipose tissue * ether phospholipids * inflammation * lipids * obesity * phospholipids * pro-inflammatory macrophages
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-025-32912-z
Králová Lesná, I.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374491

0640065 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Vrška, Dávid - Urban, M. - Neogrády, P. - Pitoňák, M.
O-Li⋯O and C-Li⋯C lithium bonds in small closed shell and open shell systems as analogues of hydrogen bonds.
Pure and Applied Chemistry. Roč. 97, č. 10 (2025), s. 1419-1434. ISSN 0033-4545. E-ISSN 1365-3075
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: C–Li–C bond * diisopropyllithium * double-well potential * H-bond * Li-bond * O–Li–O bond
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2, rok: 2024 ; AIS: 0.41, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1515/pac-2025-0532
Pitoňák, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370520

0637910 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wan, J. - Vlk, Mikuláš - Wei, C. - Tureček, F.
Nitrile-Imine-Mediated Cross-Linking of Peptides to Oligonucleotides in Gas-Phase Ion Complexes.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry. Roč. 36, č. 8 (2025), s. 1718-1728. ISSN 1044-0305. E-ISSN 1879-1123
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: photodissociation action spectroscopy * binding proteins * dispersion
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 2.7, rok: 2024 ; AIS: 0.674, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/jasms.5c00100
Tureček, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368671

0603263 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wan, J. - Vlk, Mikuláš - Nytka, M. - Kim Vu, T. N. - Lemr, Karel - Tureček, F.
Photochemical and Collision-Induced Cross-Linking of Lys, Arg, and His to Nitrile Imines in Peptide Conjugate Ions in the Gas Phase.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry. Roč. 36, č. 1 (2025), s. 209-220. ISSN 1044-0305. E-ISSN 1879-1123
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: mass spectrometry * peptide * crosslinking
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 2.7, rok: 2024 ; AIS: 0.674, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/jasms.4c00438
Lemr, Karel
- Tureček, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360475

0639394 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Warner, J. L. - Lux, Vanda - Veverka, Václav - Winston, F.
The histone chaperone Spt6 controls chromatin structure through its conserved N-terminal domain.
Molecular Cell. Roč. 85, č. 18 (2025), s. 3407-3424. ISSN 1097-2765. E-ISSN 1097-4164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX25-15442X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Spt6 * Spn1 * Elf1 * transcription elongation * RNA polymerase II * nucleosomes * histones * histone chaperones * FACT * IDR
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16.6, rok: 2024 ; AIS: 8.697, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2025.08.020
Veverka, Václav
- Winston, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369845

0601198 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Wilkovitsch, M. - Kuba, W. - Keppel, P. - Sohr, B. - Löffler, A. - Kronister, S. - del Castillo, A. F. - Goldeck, M. - Dzijak, Rastislav - Rahm, Michal - Vrábel, Milan - Svatunek, D. - Carlson, J. C. T. - Mikula, H.
Transforming Aryl-Tetrazines into Bioorthogonal Scissors for Systematic Cleavage of trans-Cyclooctenes.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 64, č. 5 (2025), č. článku e202411707. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF20-30494L; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: bioorthogonal chemistry * click chemistry * click-to-release * cleavage reactions * tetrazines
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 16.9, rok: 2024 ; AIS: 3.51, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/anie.202411707
Mikula, H.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358405

0644216 - ÚOCHB 2027 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wood, W. P. - Arhangelskis, M. - Bartůňková, Erika - Bernardes, C. E. S. - Boese, A. D. - Braun, D. E. - Bučar, D. K. - Butkiewicz, H. - Červinka, C. - Civalleri, B. - Couvrat, N. - De Ronde, E. - Dona, L. - Dračínský, Martin - Firaha, D. - Fulem, M. - Geronia, R. - Goncharova, N. - Gryl, M. - Hoja, J. - Hoser, A. - Krzeszczakowska, J. - List, A. - Loncaric, I. - Mladineo, B. - Nyman, J. - Olehovics, E. - Raimondo, M. - Rietveld, I. B. - Price, S. L.
BEST-CSP Benchmark Study of Polymorphs I and II of Sulfamerazine and the Perils of Polytype Polymorphs.
Crystal Growth & Design. Roč. 26, č. 1 (2026), s. 476-493. ISSN 1528-7483. E-ISSN 1528-7505
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: crystal-structure
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.523, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.cgd.5c01406
Price, S. L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374043

0619148 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Xian, S. - Xiang, Y. - Mitrová, Katarína - Jiráček, Jiří - Webber, M. J.
Diboronate-Modified Hyaluronic Acid for Glucose-Responsive Insulin Delivery.
Biomacromolecules. Roč. 26, č. 4 (2025), s. 2700-2707. ISSN 1525-7797. E-ISSN 1526-4602
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:61388963
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 0.95, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.biomac.5c00144
Webber, M. J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365872

0637239 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Xu, R. - Yang, Qin - Bloino, J. - Biczysko, M.
Reliable Modeling of Anharmonic Spectra Line-Shapes from VPT2 and Hybrid QM Models: IR Spectrum of Uracil as a Test Case.
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 129, č. 26 (2025), s. 5860-5880. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
GRANT EU: European Commission(XE) 101107213 - ActBio
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleic acid constituents * vibrational circular dichroism * neutron inelastic scattering
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.598, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jpca.5c02226
Yang, Qin
- Bloino, J.
- Biczysko, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368152

0637730 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, J. - Xu, Y. - Ziehr, D. R. - Taylor, M. S. - Valenstein, M. L. - Frenkel, Evgeni M. - Bush, J. R. - Rutter, K. - Stevanovski, I. - Shi, C. Y. - Kesavan, M. - Pinto, R. M. - Deveson, I. - Bartel, D. P. - Sabatini, David M. - Chivukula, R. R.
Polyglycine-mediated aggregation of FAM98B disrupts tRNA processing in GGC repeat disorders.
Science. Roč. 389, č. 6757 (2025), č. článku eado2403. ISSN 0036-8075. E-ISSN 1095-9203
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cause pontocerebellar hypoplasia * messenger RNA * tremor/ataxia syndrome
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 45.8, rok: 2024 ; AIS: 20.329, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1126/science.ado2403
Chivukula, R. R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368531

0618903 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, Q. Y. - Yang, Qin - Song, Y. F. - Liu, A. W. - Wang, J. - Tan, Y. - Sun, Y. R. - Hu, S. M.
Vibrational Analysis Based on Cavity-Enhanced Raman Spectroscopy: Cyclohexane.
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 129, č. 14 (2025), s. 3183-3193. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
GRANT EU: European Commission(XE) 101107213 - ActBio
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Herzberg-Teller * cross-section * Franck-Condon
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.598, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jpca.4c07709
Tan, Y.
- Hu, S. M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365706

0640534 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, Qin - Andrushchenko, Valery - Hudecová, J. - Kapitán, J. - Bloino, J. - Bowker, Isabelle - Bouř, Petr
Black-Box Simulations of Anharmonic Vibrational Chiroptical Spectra: Problems with Property Third Derivatives and the Solvent.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 20 (2025), s. 10489-10502. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA25-15726S
GRANT EU: European Commission(XE) 101107213 - ActBio
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Raman optical activity * circular dichroism * alpha-pinene
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5c01132
Andrushchenko, Valery
- Kapitán, J.
- Bloino, J.
- Bouř, Petr
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370899

0603081 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yesylevskyy, Semen
MolAR: Memory-Safe Library for Analysis of MD Simulations Written in Rust.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 46, č. 1 (2025), č. článku e27536. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: library * memory safety * molecular analysis * molecular dynamics simulations * Rust
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.923, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/jcc.27536
Yesylevskyy, Semen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360367

0641002 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Yi, R. H. - Hung, C. M. - Hanus, Jan - Šámal, Michal - Rybáček, Jiří - Buděšínský, Miloš - Bednárová, Lucie - Yang, L. S. - Tu, K. Y. - Chen, Y. S. - Chao, Y. C. - Stará, Irena G. - Chou, P. T. - Wong, K. T.
Solution-processed red CPL-OLEDs enabled by an exciplex-forming host and chiral helicene dopant.
Journal of Materials Chemistry C. Roč. 13, č. 43 (2025), s. 21730-21739. ISSN 2050-7526. E-ISSN 2050-7534
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-10787S
GRANT EU: European Commission(XE) 859752 - HEL4CHIROLED
AV ČR(CZ) AP2402; AV ČR(CZ) MOST-22-01
Akademická prémie - Praemium Academiae; Bilaterální spolupráce
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: CPL-OLED * helicene-based chiral emitter
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 0.968, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D5TC02788H
Chao, Y. C.
- Stará, Irena G.
- Chou, P. T.
- Wong, K. T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371236

0635637 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yurenko, Yevgen - Muždalo, Anja - Černeková, Michaela - Pecina, Adam - Řezáč, Jan - Fanfrlík, Jindřich - Žáková, Lenka - Jiráček, Jiří - Lepšík, Martin
Multiscale Computational Protocols for Accurate Residue Interactions at the Flexible Insulin-Receptor Interface.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 65, č. 11 (2025), s. 5690-5705. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17978S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: generalized born model * binding free energies * protein
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 1.526, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c00772
Lepšík, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366668