Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

0641324 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Abbühl, D. - Pružincová, Martina - Štěpánek, Luděk - Bouscasse, E. - Azevedo, R. - Matondo, M. - Varga, Vladimír - Bonnefoy, S. - Bastin, P.
A novel approach to tagging tubulin reveals microtubule assembly dynamics of the axoneme in Trypanosoma brucei.
Journal of Cell Science. Roč. 138, č. 20 (2025), č. článku jcs264145. ISSN 0021-9533. E-ISSN 1477-9137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07370S
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Trypanosoma brucei * tubulin * flagellum * grow-and-lock model * CEP164C
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.488, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1242/jcs.264145
Bastin, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374704

0644364 - ÚMG 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Banik, Poulami - Staněk, David
Decoding retinitis pigmentosa: molecular targets and therapy with focus on pre-mRNA splicing.
Cellular and Molecular Life Sciences. Roč. 83, č. 1 (2025), č. článku 20. ISSN 1420-682X. E-ISSN 1420-9071
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: mediated gene-transfer * mouse model * antisense oligonucleotide * delays degeneration * retinal function * stem-cells * mutations * rhodopsin * prpf31 * mice * Splicing * Retinitis pigmentosa * Therapeutics * Models * Molecular mechanisms
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 2.055, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s00018-025-05987-0
Staněk, David
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374215

0644361 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Basello, Davide Allesandro - Blažíková, Michaela - Roithová, Adriana - Hálová, Martina - Radivojevic, Nenad - Neugebauer, K.M. - Staněk, David
Dynamic interaction of spliceosomal snRNPs with coilin explains Cajal body characteristics.
Journal of Cell Biology. Roč. 224, č. 8 (2025), č. článku e202309128. ISSN 0021-9525. E-ISSN 1540-8140
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18103; GA ČR(CZ) GA24-11157S; GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
GRANT EU: European Commission(CZ) CZ.2.16/3.1.00/21547
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: fluorescence correlation spectroscopy * small nuclear-rna * in-vivo kinetics * dna-sequences * hela-cells * gene loci * bodies * protein * association * interphase
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.4, rok: 2024 ; AIS: 3.167, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rupress.org/jcb/article-abstract/224/8/e202309128/278087/Dynamic-interaction-of-spliceosomal-snRNPs-with?redirectedFrom=fulltext
Staněk, David
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374212

0605171 - ÚMG 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bašová, P. - Minařík, L. - Magalhaes-Novais, Silvia Carina - Balounová, Jana - Zemanová, Z. - Aghová, T. - Špaček, M. - Jonášová, A. - Gloc Pimková, K. - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Stopka, T.
Investigating resistance to 5-Azacytidine and Venetoclax in PDX models of MDS/AML.
Frontiers in Oncology. Roč. 14, 07 Jan (2025), č. článku 1414950. ISSN 2234-943X. E-ISSN 2234-943X
Grant CEP: GA MZd NU21-08-00312; GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT EF18_046/0015861
Výzkumná infrastruktura: CCP II - 90126; CCP III - 90236
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: myelodysplastic syndrome * PDX (patient derived xenograft) * 5-Azacytidine * Venetoclax (BCL2 inhibitor) * therapeutic targets
Impakt faktor: 3.3, rok: 2024 ; AIS: 0.912, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fonc.2024.1414950
Stopka, T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374812

0644721 - ÚMG 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bayona-Hernandez, A. - Miladinović, Ana - Antiga, Ludovica - Hozák, Pavel - Sztacho, M. - Castano, E.
Lipid-lncRNA Crossroads: An Overview of Interactions Between Lipids and lncRNA.
Cells. Roč. 14, č. 15 (2025), č. článku 1193. ISSN 2073-4409. E-ISSN 2073-4409
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA ČR(CZ) GA17-09103S; GA MŠMT LX22NPO5102
GRANT EU: European Commission(XE) CA19105 - EpiLipidNET
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: cancer * lncRNA * phospholipids * phase separation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2024 ; AIS: 1.421, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4409/14/15/1193
Castano, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374595

0616754 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Beránková, Michaela - Holoubek, Jiří - Hönig, Václav - Matúšová, Zuzana - Palus, Martin - Salát, Jiří - Krayem, Imtissal - Vojtíšková, Jarmila - Svoboda, P. - Prančlová, Veronika - Valihrach, Lukáš - Demant, P. - Lipoldová, Marie - Růžek, Daniel
Genotype-driven sensitivity of mice to tick-borne encephalitis virus correlates with differential host responses in peripheral macrophages and brain.
Journal of Neuroinflammation. Roč. 22, č. 1 (2025), č. článku 22. ISSN 1742-2094. E-ISSN 1742-2094
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07160S; GA ČR(CZ) GA23-08039S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:86652036 ; RVO:68378050
Klíčová slova: single nucleotide polymorphism * recombinant congenic strains * human predisposition * severe forms * gene * infection * pathogenesis * immunopathology * association * expression * Tick-borne encephalitis * Tick-borne encephalitis virus * Mouse model * Neuroinflammation * Genetics * Transcriptomics * Macrophages
Obor OECD: Virology; Neurosciences (including psychophysiology (BTO-N); Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 10.1, rok: 2024 ; AIS: 2.574, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12974-025-03354-1
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365076

0636850 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Boshnakovska, A. - Pronto, J. R. - Gall, T. - Aich, A. - Procházka, Jan - Nichtová, Zuzana - Sedláček, Radislav - Sobitov, I. - Ainatzi, S. - Lenz, C. - Katschinski, D. M. - Urlaub, H. - Voigt, N. - Rehling, P. - Kremer, L. S.
SMIM20 promotes complex IV biogenesis and Ca 2+signaling in mice heart.
Cell Reports. Roč. 44, č. 6 (2025), č. článku 115723. ISSN 2639-1856
Grant CEP: GA MŠMT EF16_013/0001789; GA MŠMT LM2023036
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: calcium handling abnormalities * activated protein-kinase * mouse models * respiratory-chain * fatty-acid * oxidase * deficiency * mutations * target * hypertrophy
Impakt faktor: 6.9, rok: 2024 ; AIS: 3.464, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2025.115723
Rehling, P.
- Kremer, L. S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374894

0642517 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brezak, M. - Sumbalová Koledová, Zuzana
Defective Mammary Epithelial Outgrowth in Transgenic EKAREV-NLS Mice: Correction via Estrogen Supplementation and Genetic Background Modification.
JOURNAL OF MAMMARY GLAND BIOLOGY AND NEOPLASIA. Roč. 30, č. 1 (2025), č. článku 1. ISSN 1083-3021. E-ISSN 1573-7039
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04974S; GA MŠMT(CZ) LL2323
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: EKAREV-NLS mouse * estradiol supplementation * ERK signaling * biosensor * mammary epithelium * genetic background * Hormonal imbalance
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.872, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s10911-025-09574-8
Sumbalová Koledová, Zuzana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374656

0638799 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brezak, M. - Khan, A. A. - Jechlinger, M. - Sumbalová Koledová, Zuzana
Live-cell imaging of mammary organoids using light sheet microscopy.
JOURNAL OF MAMMARY GLAND BIOLOGY AND NEOPLASIA. Roč. 30, č. 1 (2025), č. článku 12. ISSN 1083-3021. E-ISSN 1573-7039
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL2323
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: 3D cell culture * time-lapse * epithelium * mammary gland * light sheet microscopy
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.872, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s10911-025-09587-3
Sumbalová Koledová, Zuzana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374712

0635582 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Briere, A. - Vo, P. - Yang, B. - Adams, D. - Amano, T. - Amarie, O. - Berberovic, Z. - Bower, L. - Brown, S. D. M. - Burrill, S. - Cho, S. Y. - Clementson-Mobbs, S. - D'Souza, A. - Eskandarian, M. - Flenniken, A.M. - Fuchs, H. - Gailus-Durner, V. - Herault, Y. - de Angelis, M. H. - Jin, S. - Joynson, R. - Kang, Y. K. - Kim, H. - Masuya, H. - Meziane, H. - Nam, K. - Noh, H. - Nutter, L.M.J. - Pálková, Marcela - Procházka, Jan - Raishbrook, Miles Joseph - Riet, F. - Salazar, J. - Sedláček, Radislav - Selloum, M. - Seo, K. Y. - Seong, J. K. - Shin, H. S. - Shiroishi, T. - Stewart, M. … celkem 53 autorů
Systematic Ocular Phenotyping of Knockout Mouse Lines Identifies Genes Associated With Age-Related Corneal Dystrophies.
Investigative Ophthalmology and Visual Science. Roč. 66, č. 5 (2025), č. článku 7. ISSN 0146-0404. E-ISSN 1552-5783
Grant CEP: GA MŠMT LM2023036
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: corneal dystrophy * molecular genetics * tears * corneal wound healing * dry eyes
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.309, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1167/iovs.66.5.7
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374895

0637936 - BTÚ 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Brisudová, Petra - Stojanovic, Dana - Novák, Jaromír - Nahácka, Zuzana - Oliveira, Gabriela L. - Vaňátko, Ondřej - Dvořáková, Šárka - Endaya, Berwini - Truksa, Jaroslav - Kubísková, Monika - Foltýnová, Alice - Jirák, D. - Jirát-Ziólkowska, N. - Kučera, Lukáš - Chalupský, Karel - Klíma, Kryštof - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Mengarelli, F. - Orlando, P. - Tiano, L. - Oliveira, P. - Grasso, C. - Berridge, Michael V. - Zobalová, Renata - Anděrová, Miroslava - Neužil, Jiří
Functional mitochondrial respiration is essential for glioblastoma tumour growth.
Oncogene. Roč. 44, č. 30 (2025), s. 2588-2603. ISSN 0950-9232. E-ISSN 1476-5594
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF24-10406K; GA ČR(CZ) GX21-04607X; GA ČR(CZ) GA20-05942S; GA MZd(CZ) NU23-03-00226; GA MŠMT LM2023036
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050 ; RVO:68378041
Klíčová slova: mesenchymal stem-cells * metabolism * brain
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.3, rok: 2024 ; AIS: 1.991, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41388-025-03429-6
Zobalová, Renata
- Anděrová, Miroslava
- Neužil, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368756

0638064 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Burdová, Kamila - Hailstone, R. - Hanzlíková, Hana - Caldecott, K. W.
FEN1 is critical for rapid single-strand break repair in G1 phase.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 14 (2025), č. článku gkaf710. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA25-15199S; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008205
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: base excision-repair * dna-polymerase-beta * purified human proteins * reconstitution * requirement * pathway * damage * involvement
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf710
Hanzlíková, Hana
- Caldecott, K. W.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374864

0636904 - ÚŽFG 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Czyrek, A. A. - Baran, K. - Hrubá, Eva - Horáčková, A. - Bosáková, V. - Chudzian, J. - Fafílek, Bohumil - Lásková, V. - Štěpánková, V. - Bednář, D. - Karl, K. - Kašpárek, Petr - Bosáková, Michaela - Killinger, Michael - Szotkowská, Tereza - Procházka, Jan - Zieba, J. T. - Rico-Llanos, G. - Frič, J. - Hadzič, S. - Loku, E. - Wujak, M. - Svozilová, Kateřina - Štroblová, M. - Sedláček, Radislav - Hristová, K. - Krakow, D. - Kubovčiak, Jan - Delattre, Mathys - Bartoszewski, R. - Buchtová, Marcela - Krowarsch, D. - Chaloupková, R. - Zakrzewska, M. - Krejčí, Pavel
Increased thermal stability of FGF10 leads to ectopic signaling during development.
Cellular and Molecular Life Sciences. Roč. 82, č. 1 (2025), č. článku 167. ISSN 1420-682X. E-ISSN 1420-9071
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MZd NU23-10-00550; GA MŠMT LM2023036; GA MŠMT(CZ) LM2023055
AV ČR(CZ) AP2403
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:67985904 ; RVO:68378050
Klíčová slova: fibroblast growth factor * FGF10 * morphogen
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 2.055, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s00018-025-05681-1
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367860

0636667 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Čajánek, L. - Šmite, Sindija - Ivashchenko, Olha - Huranová, Martina
Cilia at the crossroad: convergence of regulatory mechanisms to govern cilia dynamics during cell signaling and the cell cycle.
Cell and Bioscience. Roč. 15, č. 1 (2025), č. článku 81. ISSN 2045-3701. E-ISSN 2045-3701
Grant CEP: GA ČR GA21-21612S
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: cilia * ciliary dynamics * ciliary signaling * cell cycle regulation * tissue development * ciliopathies * cancer
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 1.749, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s13578-025-01403-z

Čajánek, L. Huranová, Martina
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374723

0642439 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dal Collo, G. - Grušanovič, Srdjan - Rasouli, M. - Van Hoven-Beijen, A. - Mueller, Y.M. - van der Sande, Z. L. - van Hagen, M. - Cornelissen, J. J. - He, Y. - Wang, Y. - de Pater, E. - van der Velden, V. - Raaijmakers, M. H. G. P. - Alberich-Jorda, Meritxell - Zhao, J. - Katsikis, P.D. - Erkeland, S. J.
Immunotherapy for rapid bone marrow conditioning and leukemia depletion that allows efficient hematopoietic stem cell transplantation.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer. Roč. 13, č. 6 (2025), č. článku e011888. ISSN 2051-1426. E-ISSN 2051-1426
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: immunotherapy * Bispecific T cell engager - BiTE * pharmacokinetics-PK * leukemia * stem cell
Impakt faktor: 10.6, rok: 2024 ; AIS: 3.789, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1136/jitc-2025-011888
Katsikis, P.D.
- Erkeland, S. J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372353

0639094 - ÚEB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Damyanov, M. - Koláčková, M. - Tarbajová, V. - Bytešníková, Z. - Vintrlíková, N. - Švec, P. - Pekárková, J. - Urbiš, Petr - Havránková, J. - Záchej, S. - Pinkas, Dominik - Filimonenko, Vlada - Richtera, L. - Ridošková, A. - Húska, D.
Distinct mRNA and miRNA responses in Chlamydomonas reinhardtii reveal particle-specific adaptive mechanisms to ZnO nanoparticles and ZnO bulk.
Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts. Roč. 91, OCT (2025), č. článku 104266. ISSN 2211-9264. E-ISSN 2211-9264
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008205
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250; CzechNanoLab II - 90251
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68378050
Klíčová slova: comparative toxicity * nano-zno * transcriptome * defects * Chlamydomonas reihardtii * Nanotoxicity * ZnO * Nanoparticles * Bulk * Transcriptomics * miRNA
Obor OECD: Environmental biotechnology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 0.795, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.algal.2025.104266
Koláčková, M.
- Húska, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369607

0642116 - FGÚ 2027 DE eng J - Článek v odborném periodiku
Danačíková, Šárka - Pecina, Petr - Pecinová, Alena - Svoboda, J. - Vondrášek, David - Basello, Davide Alessandro - Čajka, Tomáš - Hadraba, Daniel - Mráček, Tomáš - Kořínek, Vladimír - Otáhal, Jakub
Development of Cellular Energy Metabolism During Differentiation of Human iPSCs into Cortical Neurons.
Molecular Neurobiology. Roč. 63, č. 1 (2026), č. článku 37. ISSN 0893-7648. E-ISSN 1559-1182
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107; GA ČR(CZ) GA22-28265S
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:68378050
Klíčová slova: human iPSCs * neuronal differentiation * cellular bioenergetics * respirometry * proteomics * metabolic flux analysis
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.083, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s12035-025-05284-8
Otáhal, Jakub
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372660

0639505 - ÚMG 2026 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Daněk, Veronika - Turečková, Jolana - Huebner, K. - Erlenbach-Wuensch, K. - Baranová, Petra - Dobeš, J. - Balounová, Jana - Šímová, Michaela - Novosadová, Vendula - Trufen, Carlos Eduardo Madureira - Procházková, Michaela - Talacko, P. - Harant, K. - Bařinka, Cyril - Beck, Inken - Schneider-Stock, R. - Sedláček, Radislav - Procházka, Jan
CUL4A exhibits tumor-suppressing role via regulation of HUWE1-mediated SMAD3 intracellular shuttling.
Cancer letters. Roč. 621, Jul (2025), č. článku 217663. ISSN 0304-3835. E-ISSN 1872-7980
Grant CEP: GA MŠMT LM2023036; GA MŠMT EF18_053/0016981; GA MŠMT ED2.1.00/19.0395; GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) LM2018126
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:86652036
Klíčová slova: colorectal-cancer * ubiquitin ligase * mesenchymal transition * targets huwe1 * differentiation * identification * tumorigenesis * activation * receptor * smurf2 * Colorectal cancer * Ubiquitination * cul4a * huwe1
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Cell biology (BTO-N)
Impakt faktor: 10.1, rok: 2024 ; AIS: 1.978, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0304383525002290?via%3Dihub
Procházka, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369924

0604258 - MBÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Delawská, Kateřina - Hájek, Jan - Voráčová, Kateřina - Kuzma, Marek - Mareš, Jan - Vicková, Kateřina - Kádek, Alan - Tučková, Dominika - Gallob, F. - Divoká, Petra - Moos, M. - Opekar, S. - Koch, L. - Saurav, Kumar - Sedlák, David - Novák, Petr - Urajová, Petra - Dean, Jason Lawrence - Gažák, Radek - Niedermeyer, T. J. H. - Kameník, Zdeněk - Šimek, P. - Villunger, A. - Hrouzek, Pavel
Discovery of nostatin A, an azole-containing proteusin with prominent cytostatic and pro-apoptotic activity.
Organic & Biomolecular Chemistry. Roč. 23, č. 2 (2025), s. 449-460. ISSN 1477-0520. E-ISSN 1477-0539
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-05649K; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624; GA MŠMT(CZ) LM2018130
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; CZ-OPENSCREEN III - 90130
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: natural-products * cell-cycle * biosynthesis * strategies * inhibitors * microcins * peptides * sponge
Obor OECD: Microbiology; Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 2.7, rok: 2024 ; AIS: 0.518, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2025/ob/d4ob01395f
Hrouzek, Pavel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361630

0636848 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dlouhá, D. - Chytilová, S. - Vymetalova, J. - Rohlová, Eva - Lukášová, M. - Nováková, Š. - Hubáček, J. A.
Increased Donor-Derived Cell-Free DNA as a Predictor for the Early Detection of Antibody-Mediated Rejection Following Heart Transplantation.
CLINICAL TRANSPLANTATION. Roč. 39, č. 6 (2025), č. článku e70209. ISSN 0902-0063. E-ISSN 1399-0012
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: biomarker * cfDNA * rejection * SNP * transplantation
Impakt faktor: 1.9, rok: 2024 ; AIS: 0.857, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1111/ctr.70209
Dlouhá, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374911

0644202 - BTÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dubišová, Mária - Boháčová, Klára - Nahácka, Zuzana - Kraus, Daniel - Novák, Jaromír - Dvořáková, Šárka - Brisudová, Petra - Danešová, Natálie - Selvi, Saba - Hrysiuk, Mariia - Berwini, B. Endaya - Panagiotis, Botsios - Dan-Diem, Thi. Le - Novotná, Monika - Vodenková, Soňa - Truksa, Jaroslav - Chalupský, Karel - Klíma, Kryštof - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Mengarelli, F. - Orlando, P. - Tiano, L. - Boukalová, Štěpána - Berridge, M.V. - Zobalová, Renata - Neužil, Jiří
Mitochondrial Transfer Rescues Respiration to Support De Novo Pyrimidine Biosynthesis and Tumor Progression.
Cancer Research. (2025). ISSN 0008-5472. E-ISSN 1538-7445
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX21-04607X; GA ČR(CZ) GF24-10406K; GA ČR(CZ) GA23-05303S; GA MZd(CZ) NU23-03-00226; GA MZd(CZ) NU22J-03-00033; GA MŠMT LM2023036; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT LX22NPO5102
Výzkumná infrastruktura: CCP III - 90236; Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050 ; RVO:68378041 ; RVO:61388963
Klíčová slova: mitochondrial transfer
Obor OECD: Oncology; Oncology (UMG-J); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UEM-P); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 16.6, rok: 2024 ; AIS: 4.538, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-24-0737
Zobalová, Renata
- Neužil, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374216

0617135 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Duric, Iris - Krayem, Imtissal - Brdička, Tomáš
WBP1L, a transmembrane adaptor protein involved in the regulation of hematopoiesis, is controlled by CRL1 β _ TrCP ubiquitin ligases.
Biochemical and Biophysical Research Communications. Roč. 749, 16 Feb (2025), č. článku 151337. ISSN 0006-291X. E-ISSN 1090-2104
Grant CEP: GA ČR GA21-25527S; GA MŠMT EF18_046/0015861
Výzkumná infrastruktura: CCP III - 90236
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: WBP1L * NEDD4-Family ubiquitin ligases * cullin-RING ubiquitin ligases * interferon gamma receptor * membrane adaptor proteins
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.573, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2025.151337
Brdička, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374902

0616504 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dušek, J. - Mejdrová, Ivana - Dohnalová, Klára - Smutný, T. - Chalupský, Karel - Krutáková, M. - Škoda, J. - Rashidian, A. - Pavková, I. - Škach, Kryštof - Hricová, Jana - Chocholoušková, M. - Smutná, L. - Kamaraj, R. - Hroch, M. - Leníček, M. - Mičuda, S. - Pijnenburg, D. - van Beuningen, R. - Holčapek, M. - Vítek, L. - Ingelman-Sundberg, M. - Burk, O. - Kronenberger, T. - Nencka, Radim - Pávek, P.
The hypolipidemic effect of MI-883, the combined CAR agonist/ PXR antagonist, in diet-induced hypercholesterolemia model.
Nature Communications. Roč. 16, February (2025), č. článku 1418. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000109; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607; GA ČR GA22-05167S; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008189; GA MŠMT EF18_046/0015861; GA MŠMT LM2023036
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: pregnane X receptor * constitutive androstane receptor * bile acid
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-56642-y
Nencka, Radim
- Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363510

0645063 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dvořák, M. - Arbon, Dominik - Salát, Jiří - Fořtová, Andrea - Reguera, David Pajuelo - Frčková, T. - Holoubek, Jiří - Balounová, Jana - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Růžek, Daniel
Sex-dependent impairment of antibody responses to tick-borne encephalitis virus vaccination and infection in obese mice.
Journal of General Virology. Roč. 106, č. 10 (2025), č. článku 002161. ISSN 0022-1317. E-ISSN 1465-2099
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07160S
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:60077344
Klíčová slova: immune response * obesity * tick-borne encephalitis * tick-borne encephalitis virus * vaccination
Obor OECD: Virology; Virology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.975, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1099/jgv.0.002161
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374909

0640575 - FGÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Džubanová, Martina - Ferenčáková, Michaela - Nguyen, Dung Kim - Bardová, Kristina - Golovina, Elena - Fehervary, H. - Beňová, Andrea - Odabaşi, Yusuf - Naraine, Ravindra - Šindelka, Radek - Špoutil, František - Procházka, Jan - Čajka, Tomáš - van Lenthe, G. H. - Sarkis, R. - Naveiras, O. - Rossmeisl, Martin - Kopecký, Jan - Tencerová, Michaela
Glutamine: A novel player in maintaining skeletal strength and body fitness in obese mice.
Clinical Nutrition. Roč. 54, Nov (2025), s. 162-176. ISSN 0261-5614. E-ISSN 1532-1983
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-12243S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Novo Nordisk Fonden(DK) NNF20SA0066174
Výzkumná infrastruktura: CCP II - 90126; CCP III - 90236
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:68378050 ; RVO:86652036
Klíčová slova: obesity-induced bone impairment * glutamine-enriched diet * bone marrow adiposity * bone marrow stromal cells * glutamine metabolism * adipose-derived stem cells
Obor OECD: Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Impakt faktor: 7.4, rok: 2024 ; AIS: 1.937, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.clnu.2025.09.018
Tencerová, Michaela
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370940

0641452 - BTÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Endaya, Berwini - Kučera, Lukáš - Le, Thi Dan Diem - Spinelli, J. B. - Brozkova, A. - Luptáková, Dominika - Klíma, Kryštof - Oliveira, Gabriela L. - Brisudová, Petra - Boháčová, Klára - Boukalová, Štěpána - Zobalová, Renata - Kolář, František - Chalupský, Karel - Dohnalová, Klára - Yarmohammadi-Barzegar, A. - Dvořáková, Šárka - Biryukova, Evgeniya - Kaliaeva, Marta - Havlíček, Vladimír - Sedláček, Radislav - Procházka, Jan - Vítek, L. - Park, S. - Martásek, P. - Krška, Z. - Oliveira, P. J. - Berridge, M.V. - Neužil, Jiří
Regenerating liver uses ammonia to support de novo pyrimidine synthesis and cell proliferation.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 9664. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX21-04607X; GA MZd(CZ) NU23-03-00226; GA ČR(CZ) GA23-05303S; GA MZd(CZ) NU22-08-00160; GA ČR(CZ) GA23-04671S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050 ; RVO:61388971 ; RVO:67985823
Klíčová slova: urea cycle * dihydroorotate dehydrogenase * mitochondrial-function * dna-synthesis * metabolism
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemical research methods (MBU-M); Biochemistry and molecular biology (FGU-C)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-025-65451-2

Endaya, Berwini Neužil, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371615

0619821 - BTÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Frolíková, Michaela - Blažíková, Michaela - Čapek, Martin - Chmelová, Helena - Valečka, Jan - Koláčková, Veronika - Valášková, Eliška - Gregor, Martin - Komrsková, Kateřina - Horváth, Ondřej - Novotný, Ivan
Innovative sample preparation using alcohol dehydration and high refractive index medium enables acquisition of two-channel super-resolution 3D STED image of an entire oocyte.
Journal of Microscopy. Roč. 297, č. 2 (2025), s. 165-178. ISSN 0022-2720. E-ISSN 1365-2818
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA ČR(CZ) GA22-30494S; GA ČR GA21-21736S
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050 ; RVO:61389030
Klíčová slova: alcohol dehydration * 3D STED * oocyte * large biological objects * high refractive index medium * sample preparation * super-resolution
Obor OECD: Civil engineering
Impakt faktor: 1.9, rok: 2024 ; AIS: 0.491, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jmi.13363
Novotný, Ivan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367568

0645076 - ÚMG 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Gáliková, Eliška - Přikryl, David - Prost, Salomé - Kučerová, Dana - Trejbalová, Kateřina - Hejnar, Jiří
Single Amino Acid Residue W33 of tva Receptor Is Critical for Viral Entry and High-Affinity Binding of Avian Leukosis Virus Subgroup K.
Viruses. Roč. 17, č. 5 (2025), č. článku 709. ISSN 1999-4915. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: cellular receptor * sarcoma * infection * gene * resistant * chickens * susceptibility * identification * envelope * explain * avian leukosis virus * tva receptor * chicken * guineafowl
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 0.895, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/17/5/709
Hejnar, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374927

0637392 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gemperle, Jakub - Lisse, D. - Kappen, M. - Secret, E. - Coppey, M. - Gregor, Martin - Menager, C. - Piehler, J. - Caswell, P.
Live-cell magnetic manipulation of recycling endosomes reveals their direct effect on actin protrusions to promote invasive migration.
Science Advances. Roč. 11, č. 27 (2025), č. článku eadu6361. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Grant CEP: GA ČR GA21-21736S; GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: gtp-binding protein * alpha-5-beta-1 integrin * rab25 * transport * motility * cancer * network * pathway * growth * rab11
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 4.859, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1126/sciadv.adu6361

Gemperle, Jakub Caswell, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372273

0643394 - ÚMCH 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gui, Wentao - Páral, P. - Dhamija, B. - Hagag, E. - Duša, M. - Humajová, J. - Francova, P. V. - Kučka, Jan - Pankrác, J. - Schütz, C. - Armenis, V. - Ferrucci, F. - Schubert, M. - Guan, K. - Baenke, F. - Stange, D. E. - Lehmann, L. H. - Weckwerth, W. - Mirtschink, P. - Traikov, S. - Giuseppe, B. - Miracco, C. - Bornhäuser, M. - Minucci, S. - Šefc, L. - Macůrek, Libor - Elgendy, Mohamed
MCL1 modulates mTORC1 signaling to promote bioenergetics and tumorigenesis.
Nature Communications. Roč. 16, 1 December (2025), č. článku 10841. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ19-22156Y; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA MŠMT LX22NPO5102
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:61389013 ; RVO:68378050
Klíčová slova: MCL1 * mTOR * mTORC1
Obor OECD: Polymer science; Cell biology (UMG-J)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-025-66831-4
Elgendy, Mohamed
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373352

0618822 - ÚMG 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Herstine, J. A. - Mensh, J. - Coffman, E. - George, S. M. - Herman, K. - Martin, J. B. - Zatari, A. - Chandler, H. L. - Kozmik, Zbyněk - Drysdale, Thomas A. - Bridgewater, D. - Plageman Jr., T. F.
Shroom3 facilitates optic fissure closure via tissue alignment and reestablishment of apical-basal polarity during epithelial fusion.
Developmental Biology. Roč. 522, June (2025), s. 91-105. ISSN 0012-1606. E-ISSN 1095-564X
Grant CEP: GA ČR GA21-27364S
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: retinal-pigment epithelium * cell-shape * morphogenesis * constriction * ezrin * microvilli * protein * polarization * recruitment * activation
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 2.1, rok: 2024 ; AIS: 0.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2025.03.008
Plageman Jr., T. F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374843

0635731 - ÚMG 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hrčkulák, Dušan - Onhajzer, Jakub - Krausová, Michaela - Šťastná, Monika - Kříž, Vítězslav - Janečková, Lucie - Kořínek, Vladimír
Development of a new flippase-dependent mouse model for red fluorescence-based isolation of KRAS-G12D oncogene-expressing tumor cells.
Transgenic Research. Roč. 34, č. 1 (2025), č. článku 9. ISSN 0962-8819. E-ISSN 1573-9368
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA ČR GA20-31322S; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: k-ras * lung-cancer * cre recombinase * proliferation * progression * mutations * efficacy * apc * Colon cancer * Gene targeting * KRAS oncogene * Intestinal organoids * Lung cancer * MRTX1133 inhibitor
Obor OECD: Oncology
Impakt faktor: 2, rok: 2024 ; AIS: 0.457, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s11248-024-00429-2?utm_source=getftr&utm_medium=getftr&utm_campaign=getftr_pilot&getft_integrator=scopus
Kořínek, Vladimír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366765

0604926 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hsu, A. T. - Bugajev, Viktor - Gottschalk, T. A. - Demková, Lívia - Potůčková, Lucie - Dráberová, Lubica - Bambousková, Monika - Hagemann, P. - O'Brien, C. A. - Riečan, Martin - Kuda, Ondřej - Tsantikos, E. - Dráber, Petr - Wright, M. D. - van Spriel, A. B. - Hibbs, M. L. - Hálová, Ivana
Tetraspanin CD53 Promotes Inflammation but Restrains Mucus Production in a Mouse Model of Allergic Airway Inflammation.
Allergy. Roč. 80, č. 4 (2025), s. 1127-1131. ISSN 0105-4538. E-ISSN 1398-9995
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA ČR GA20-16481S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:67985823
Klíčová slova: mast cell * tetraspanins * immunoglobulin E * cytokines * asthma * anaphylaxis
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 12, rok: 2024 ; AIS: 3.158, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/all.16426
Hibbs, M. L.
- Hálová, Ivana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362458

0635709 - ÚŽFG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hubiernatorova, Anastasiia - Novák, Josef - Vaškovičová, Michaela - Sekáč, David - Kropyvko, S. - Hodný, Zdeněk
Tristetraprolin affects invasion-associated genes expression and cell motility in triple-negative breast cancer model.
Cytoskeleton. Roč. 82, č. 5 (2025), s. 311-326. ISSN 1949-3584. E-ISSN 1949-3592
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004562; GA ČR(CZ) GA24-11357S
AV ČR(CZ) StrategieAV21/29
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:67985904 ; RVO:68378050
Klíčová slova: breast cancer * doxorubicin * invasion
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 1.6, rok: 2024 ; AIS: 0.663, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cm.21934
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366739

0616772 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Chhatre, A. - Štěpánek, Luděk - Nievergelt, A.P. - Viar, G. A. - Diez, S. - Pigino, G.
Tubulin tyrosination/detyrosination regulate the affinity and sorting of intraflagellar transport trains on axonemal microtubule doublets.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 1055. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: tyrosination * proteins * complex * motor * visualization * reinhardtii * initiation * kinesin-2 * motility * reveals
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-56098-0
Diez, S.
- Pigino, G.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374818

0618330 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Imada, Y. - Rouhová, Lenka - Žurovcová, Martina - Hradilová, Miluše - Podlahová, Šárka - Sehadová, Hana - Žurovec, Michal
Absence of fibroin H sequences and a significant divergence in the putative fibroin L homolog in Neomicropteryx cornuta (Micropterigidae) silk.
Communications Biology. Roč. 8, č. 1 (2025), č. článku 434. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
European Community’s Program Interreg Bayern-Tschechien / Evropský fond pro regionální rozvoj(DE) BYCZ01-039; GA MŠk(CZ) CZ.1.05/1.1.00/02.0109
INTERREG Bavorsko – Česko
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: Bombyx-mori * sericin * diversification * fractionation * conservation * Lepidoptera * protein * cocoon
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s42003-025-07801-w.pdf
Žurovec, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373410

0619192 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Janečková, Lucie - Šťastná, Monika - Hrčkulák, Dušan - Berková, Linda - Kubovčiak, Jan - Onhajzer, Jakub - Kříž, Vítězslav - Dostalíková, Stela - Műllerová, Tereza - Večerková, Kateřina - Tenglerová, Markéta - Coufal, Štěpán - Kostovčíková, Klára - Blumberg, R.S. - Filipp, Dominik - Basler, K. - Valenta, Tomáš - Kolář, Michal - Kořínek, Vladimír
Tcf4 regulates secretory cell fate decisions in the small intestine and colon tumors: insights from transcriptomic, histological, and microbiome analyses.
Stem Cell Research & Therapy. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 170. ISSN 1757-6512. E-ISSN 1757-6512
Grant CEP: GA ČR GA20-31322S; GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597; GA MŠMT(CZ) LM2023050
AV ČR(CZ) LQ200202105
Prémie Lumina quaeruntur
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388971
Klíčová slova: lectin regiii-gamma * lgr5(+) stem-cells * single-cell * paneth cells * homeostasis * differentiation * adenocarcinoma * proliferation * regeneration * compartments * Antimicrobial peptides * Paneth cells * Intestinal cell lineage * Colorectal cancer * Intestinal crypt * Single-cell transcriptomics
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 7.3, rok: 2024 ; AIS: 1.559, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://stemcellres.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13287-025-04280-y

Janečková, Lucie Kořínek, Vladimír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365929

0642626 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jansa, Petr - Tanieli, Giordano - Vučinić, Kim - Lustyk, Diana - Fusek, Karel - Vališková, Barbora - Morimoto, K. - Mizuno, E. - Ullrich, K. - Odenthal-Hesse, L. - Provazník, J. - Benes, V. - Pfeiferová, Lucie - Kolář, Michal - Gergelits, V. - Piálek, Jaroslav - Forejt, Jiří
Mouse X-linked microRNA cluster regulates the meiotic checkpoint and Prdm9- driven hybrid sterility in a copy number-dependent manner.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 122, č. 40 (2025), č. článku 2510229122. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR GA19-12774S; GA ČR GA22-29928S
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:68081766
Klíčová slova: meiosis * PRDM9 * speciation * Tiprl
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UBO-W)
Impakt faktor: 9.1, rok: 2024 ; AIS: 4.117, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1073/pnas.2510229122

Jansa, Petr Forejt, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372500

0619145 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jiroušková, Markéta - Harant, K. - Cejnar, P. - Ojha, Srikant - Korelová, Kateřina - Sarnová, Lenka - Sticová, E. - Mayr, Ch. H. - Schiller, H. B. - Gregor, Martin
Dynamics of compartment-specific proteomic landscapes of hepatotoxic and cholestatic models of liver fibrosis.
eLife. Roč. 13, Apr 8 (2025), č. článku RP98023. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MZd NU21-04-00100; GA ČR GA21-21736S; GA ČR GA18-02699S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250; CCP II - 90126
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: mass spectrometry * matrisome * collagen deposits * atomic force microscopy * clusterin
Impakt faktor: nepřidělen/n.a., rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.7554/eLife.98023

Jiroušková, Markéta Gregor, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372292

0637564 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jurášek, M. - Dráberová, Eduarda - Řehulka, J. - Gurská, S. - Ivanová, A. - Polishchuk, P. - Ječmeňová, K. - Fähnrich, J. - Marešová, A. - Tauchen, J. - Romero, A. R. - Dömling, A. - Hajdúch, M. - Drašar, P. B. - Dráber, Pavel - Džubák, P.
Colchicine-BODIPY Probes: Evidence for the Involvement of Intracellular Membranes in the Targeting of Colchicine to Tubulin.
ACS Pharmacology & Translational Science. Roč. 8, č. 7 (2025), s. 1965-1985. E-ISSN 2575-9108
Grant CEP: GA ČR GA21-30281S; GA MŠMT LTAUSA19118; GA MŠMT LX22NPO5102
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140; CZ-OPENSCREEN IV - 90252; EATRIS-CZ IV - 90253; Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: colchicine * BODIPY * cytotoxicity * flow-cytometry * cell-cycle * tubulin polymerization * intracellular membranes * fluorescence microscopy * in silico modeling
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.164, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsptsci.4c00730
Dráber, Pavel
- Džubák, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374653

0637607 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kamaraj, R. - Mejdrová, Ivana - Krutáková, M. - Smutný, T. - Škach, Kryštof - Dohnalová, Klára - Smutná, L. - Nellore, D. S. S. - Dušek, J. - Chalupský, Karel - Hricová, Jana - Kronenberger, T. - Stahl, A. - Templin, M. - Braeuning, A. - Nencka, Radim - Pávek, P.
Discovery of PXR Antagonist MI891 and PXR Degrader MI1013 and Their Roles in Hepatic Gene Regulation.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 68, č. 14 (2025), s. 14271-14299. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607; GA ČR(CZ) GA24-11114S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: pregnane X receptor * analogs
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c03134
Nencka, Radim
- Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368439

0637902 - ÚMG 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Kapustová, A. - Macášek, P. - Baďurová, B. - Melegová, J. - Rimpelová, S. - Kubovčiak, Jan - Šáchová, Jana - Hradilová, Miluše - Kolář, Michal - Vítek, L. - Ruml, T. - Gbelcova, H.
In Vitro Investigation of Statin Effects on Genes Associated with Severe COVID-19 in Cancerous and Non-Cancerous Cells.
Biomedicines. Roč. 13, č. 7 (2025), č. článku 1714. E-ISSN 2227-9059
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000785
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Covid-19 * statins * APOE * ACE2 * microarray analyses * gene expression
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 0.89, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2227-9059/13/7/1714
Gbelcova, H.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374857

0642516 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Khan, Z. A. - Labala, Rajendra Kumar - Ju, L. - Gravenstein, N. - Setlow, B. - Martynyuk, A. E.
Contribution of the Brain-Gut-Microbiome Axis to Intergenerational Abnormalities in a Rat Model of Perioperative Neurocognitive Disorder.
Anesthesiology. Roč. 143, č. 6 (2025), s. 1527-1543. ISSN 0003-3022. E-ISSN 1528-1175
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: brain-gut-microbiome (BGM) * bumetanide * therapeutic efficacy
Impakt faktor: 9.1, rok: 2024 ; AIS: 2.825, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1097/ALN.0000000000005745
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374689

0645074 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kompaníková, P. - Attri, Kriti - Czimer, D. - Hubiernatorova, Anastasiia - Trela-Kobedza, E. - Zimčík, David
Advancing developmental biology in Central Europe: report from the V4SDB meeting 2025.
Biology Open. Roč. 14, č. 12 (2025), č. článku bio062360. ISSN 2046-6390. E-ISSN 2046-6390
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA25-17360S; GA MŠMT(CZ) LL2323; GA MZd(CZ) NW24-10-00204
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:67985904
Klíčová slova: Visegrad Group Society for Developmental Biology * v4sdb * Developmental biology * Early development * Organogenesis * Evo-devo * Stem cells
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Developmental biology (UZFG-Y)
Impakt faktor: 1.7, rok: 2024 ; AIS: 0.612, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.biologists.com/bio/article/14/12/bio062360/370087/Advancing-developmental-biology-in-Central-Europe
Kompaníková, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374925

0617708 - ÚMG 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Korec, E. - Ungrová, Lenka - Kalvas, J. - Hejnar, Jiří
Identification of genes associated with longevity in dogs: 9 candidate genes described in Cavalier King Charles Spaniel.
Veterinary and Animal Sciences. Roč. 27, March (2025), č. článku 100420. E-ISSN 2451-943X
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: longevity-associated genes * GWAS * Cavalier King Charles Spaniel dog * extending lifespan * longevity testing
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.455, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.vas.2024.100420
Korec, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374855

0642388 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kosanovič, Slaďana - Vaníčková, Karolína - Milošević, Mirko - Ribeiro Bas, Irina - Chilinski, M. - Plewczynski, D. - Daněk, Petr - Rohlena, Jakub - Rohlenová, Kateřina - Alberich-Jorda, Meritxell
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis.
Experimental Hematology. Roč. 147, July (2025), č. článku 104792. ISSN 0301-472X. E-ISSN 1873-2399
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA ČR GA22-18300S
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050
Klíčová slova: hematology * granulopoiesis * lipopolysaccharide (LPS)
Impakt faktor: 2.1, rok: 2024 ; AIS: 0.927, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.exphem.2025.104792
Alberich-Jorda, Meritxell
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372324

0645075 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Krchlíková, V. - Braun, E. - Weiss, J. - Štafl, Kryštof - Jech, Lukáš - Badarinarayan, S. S. - Lotke, R. - Trávníček, Martin - Baur, C. - Stark, P. - Haussmann, I. - Lu, Y. - Petersen, M. - Cui, W. - Wang, W. - Faeger, B. M. - Reisinger, H. - Tokunaga, K. - Cingoez, O. - Sparrer, K. M. J. - Salker, M. S. - Hejnar, Jiří - Kirchhoff, F. - Trejbalová, Kateřina - Sauter, D.
Inhibition of placental trophoblast fusion by guanylate-binding protein 5.
Science Advances. Roč. 11, č. 19 (2025), č. článku eadt5388. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: x-ray structures * envelope glycoprotein * preeclampsia * furin * cytotrophoblasts * syncytin-2 * infection * serinc5 * cells
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 4.859, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.science.org/doi/epdf/10.1126/sciadv.adt5388
Sauter, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374926

0645060 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kučerová, J. - Zdrha, A. - Rozbeský, Daniel - Shinde, A.P. - Nebesářová, Jana - Narayanasamy, R. K. - Smutná, T. - Hrdý, I. - Tachezy, J.
Characterization of the sTim/MIA pathway in Metamonada reveals different evolutionary adaptations to anaerobiosis.
Current Biology. Roč. 35, č. 23 (2025), s. 5734-5749. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250; e-INFRA CZ II - 90254; ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:60077344
Klíčová slova: small Tims * Trichomonas vaginalis * protein import * hydrogenosome * anaerobiosis
Obor OECD: Cell biology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 7.5, rok: 2024 ; AIS: 3.993, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.cub.2025.10.027
Tachezy, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374908

0642229 - ÚMG 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kulmann, Marcos Iuri Roos - Táborská, Eliška - Benköova, B. - Palus, Martin - Drobek, Aleš - Horvat, Filip - Pasulka, Josef - Malík, Radek - Šályová, Eva - Hönig, Václav - Pellerova, M. - Borsanyiova, M. - Nedvědová, Lenka - Štěpánek, Ondřej - Bopegamage, S. - Růžek, Daniel - Svoboda, Petr
Enhanced RNAi does not provide efficient innate antiviral immunity in mice.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 1 (2025), č. článku gkae1288. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR GX20-03950X; GA ČR(CZ) GA23-08039S; GA ČR GA22-18046S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) LM2018126; GA MŠMT LM2023036; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254; ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Encephalitis Viruses * Tick-Borne * DEAD-box RNA Helicases
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Virology (BC-A)
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/53/1/gkae1288/7945392
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372160

0618627 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kusari, Fitore - Backová, L. - Pánek, D. - Benda, A. - Trachtulec, Zdeněk
Label-free metabolic fingerprinting of motile mammalian spermatozoa with subcellular resolution.
BMC Biology. Roč. 23, č. 1 (2025), č. článku 85. ISSN 1741-7007. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA ČR GA19-06272S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250; CCP III - 90236; CESNET II - 90042
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: FLIM * sperm * metabolism * NADH * NADPH * fertility * artificial intelligence
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12915-025-02167-1

Kusari, Fitore Trachtulec, Zdeněk
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374854