Zákopčaník Marek

0643705 - MBÚ 2026 RIV eng J - Článek v odborném periodiku
Ferroussier, Q. C. - Gupta, Sadanand - Tichý, Martin - Al-Amoudi, A. - Lukeš, Martin - Štipl, Daniel - Koník, Peter - Bína, David - Zákopčaník, Marek - Novák, Petr - Sobotka, Roman - Komenda, Josef - Naschberger, A.
High-resolution structural analysis of the cyanobacterial photosystem I complex reveals independent incorporation of small transmembrane and cytoplasmic subunits.
Plant Communications. Roč. 6, č. 12 (2025), č. článku 101493. ISSN 2590-3462. E-ISSN 2590-3462
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-10227S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
GRANT EU: European Commission(CZ) 854126 - PhotoRedesign
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Photosynthetic energy * cyanobacterial photosystem * chlorophylls
Obor OECD: Microbiology; Biochemistry and molecular biology (BC-A)
Impakt faktor: 11.6, rok: 2024 ; AIS: 3.276, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S259034622500255X?via%3Dihub
Komenda, Josef
- Naschberger, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373592

0598163 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Škerlová, Jana - Brynda, Jiří - Šobotník, Jan - Zákopčaník, Marek - Novák, Petr - Bourguignon, T. - Sillam-Dussès, D. - Řezáčová, Pavlína
Crystal structure of blue laccase BP76, a unique termite suicidal defense weapon.
Structure. Roč. 32, č. 10 (2024), s. 1581-1585. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: Neocapritermes taracua * colony defence * autothysis * benzoquinone * X-ray crystallography * single-wavelength anomalous diffraction * laccase * insect glycosylation * protein stabilization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Ecology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.07.015
Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355900

0587857 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zákopčaník, Marek - Kavan, Daniel - Kukačka, Zdeněk - Novák, Petr - Loginov, Dmitry Sergej
Data-Independent Acquisition Represents a Promising Alternative for Fast Photochemical Oxidation of Proteins (FPOP) Samples Analysis.
Analytical Chemistry. Roč. 96, č. 28 (2024), s. 11273-11279. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-27695S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624; GA TA ČR(CZ) TH86010001
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: peptide identification * mass * Oxidation of Proteins
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.7, rok: 2024 ; AIS: 1.132, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/epdf/10.1021/acs.analchem.4c01084
Loginov, Dmitry Sergej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355156

0583029 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zákopčaník, Marek - Kavan, Daniel - Novák, Petr - Loginov, Dmitry Sergej
Quantifying the Impact of the Peptide Identification Framework on the Results of Fast Photochemical Oxidation of Protein Analysis.
Journal of Proteome Research. Roč. 23, č. 2 (2023), s. 609-617. ISSN 1535-3893. E-ISSN 1535-3907
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: mass-spectrometry * exchange * fpop * searchengine * structural proteomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023 ; AIS: 1.187, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.3c00390
Loginov, Dmitry Sergej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351128

0585513 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zákopčaník, Marek - Kavan, Daniel - Novák, Petr - Loginov, Dmitry Sergej
Quantifying the Impact of the Peptide Identification Framework on the Results of Fast Photochemical Oxidation of Protein Analysis.
Journal of Proteome Research. Roč. 23, č. 2 (2024), s. 609-617. ISSN 1535-3893. E-ISSN 1535-3907
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-27695S
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: mass-spectrometry * exchange * fpop * searchengine * structural proteomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.223, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.3c00390
Loginov, Dmitry Sergej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353197