Publikace ASEP
0576651 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mujakić, Izabela - Cabello-Yeves, Pedro J. - Villena-Alemany, Cristian - Piwosz, K. - Rodriguez-Valera, F. - Picazo, A. - Camacho, A. - Koblížek, Michal
Multi-environment ecogenomics analysis of the cosmopolitan phylum Gemmatimonadota.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, č. 5 (2023), č. článku e0111223. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Gemmatimonadota * gemmatimonadetes * anoxygenic phototrophs * MAGs * metagenome * RuBisCO
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 1.02, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.01112-23
Mujakić, Izabela Koblížek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0347823
0587858 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, K. - Villena-Alemany, Cristian - Całkiewicz, J. - Mujakić, Izabela - Náhlík, V. - Dean, Jason Lawrence - Koblížek, Michal
Response of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria to limitation and availability of organic carbon.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 100, č. 7 (2024), č. článku fiae090. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: natural environments * growth * diversity * light * rates * nov * acetate * aerobic anoxygenic phototrophic bacteria * carbon limitation * freshwater lakes * lignin * microbial ecology
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 0.967, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsec/article/100/7/fiae090/7695299?login=true
Piwosz, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355158
0556152 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Villena-Alemany, Cristian - Mujakić, Izabela
Photoheterotrophy by aerobic anoxygenic bacteria modulates carbon fluxes in a freshwater lake.
The ISME Journal. Roč. 16, č. 4 (2022), s. 1046-1054. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: bacterioplankton respiratory quotient * semi-micro determination * phototrophic bacteria * surface waters * light * populations * sequences * silva
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11, rok: 2022 ; AIS: 3.26, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41396-021-01142-2
Piwosz, Kasia
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0330486
0643753 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Spilling, K. - Vanharanta, M. - Santoro, M. - Villena-Alemany, Cristian - Labrenz, M. - Grossart, H. - Piwosz, K.
Picophytoplankton act as the primary consumers of excess phosphorus after the spring bloom in the eutrophic Baltic Sea.
Limnology and Oceanography. Roč. 70, S2 December (2025), s. 55-68. ISSN 0024-3590. E-ISSN 1939-5590
GRANT EU: European Commission(CZ) 731065 - EU H2020-INFRAIA
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: nitrogen-fixation * phytoplankton community * forming cyanobacteria * organic-matter * stoichiometry * mesocosm * gradient * finland * events * system
Obor OECD: Oceanography
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.304, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://aslopubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/lno.70027
Spilling, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373614
0585725 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Stojan, I. - Šantić, D. - Villena-Alemany, Cristian - Trumbic, Z. - Matic, F. - Tomas, A. V. - Pleic, I. L. - Piwosz, K. - Kušpilić, G. - Gladan, Z. N. - Šestanović, S. - Šolić, M.
Ecology of aerobic anoxygenic phototrophs on a fine-scale taxonomic resolution in Adriatic Sea unravelled by unsupervised neural network.
Environmental Microbiome. Roč. 19, č. 1 (2024), č. článku 28. E-ISSN 2524-6372
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: in-situ hybridization * surface waters * growth-rates * bacterioplankton groups * seasonal dynamics * mediterranean sea * bacteria * diversity * identification * abundance
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 1.543, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://environmentalmicrobiome.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40793-024-00573-6
Šantić, D.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353419
0618805 - MBÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Šantić, D. - Stojan, I. - Tomas, A. V. - Roje, B. M. - Mujakić, Izabela - Villena-Alemany, Cristian - Koblížek, Michal - Jozic, S. - Šolić, M. - Šestanović, S.
Contribution of different bacterial groups in the carbon flow through the microbial food web.
Estuarine Coastal and Shelf Science. Roč. 318, July 15 (2025), č. článku 109228. ISSN 0272-7714. E-ISSN 1096-0015
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * nucleic-acid bacterioplankton * growth-rates * adriatic sea * picoplankton community * heterotrophic bacteria * leucine incorporation * coastal waters * grazing impact * bottom-up * Prokaryotes * Aerobic anoxygenic phototrophs * Microbial community structure * Microbial activity * Food chains * Biochemical cycles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.6, rok: 2024 ; AIS: 0.652, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0272771425001064?via%3Dihub
Šantić, D.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365797
0619769 - MBÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Šantić, D. - Stojan, I. - Tomas, A. V. - Roje, B. M. - Mujakić, Izabela - Villena-Alemany, Cristian - Koblížek, Michal - Jozic, S. - Šolić, M. - Šestanović, S.
Contribution of different bacterial groups in the carbon flow through the microbial food web.
Estuarine Coastal and Shelf Science. Roč. 318, July 15 (2025), č. článku 109228. ISSN 0272-7714. E-ISSN 1096-0015
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Prokaryotes * Aerobic anoxygenic phototrophs * Microbial community structure * Microbial activity * Food chains * Biochemical cycles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.6, rok: 2024 ; AIS: 0.652, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0272771425001064
Šantić, D.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0366410
0597546 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vanharanta, M. - Santoro, M. - Villena-Alemany, Cristian - Piiparinen, J. - Piwosz, K. - Grossart, H. - Labrenz, M. - Spilling, K.
Microbial remineralization processes during postspring-bloom with excess phosphate available in the northern Baltic Sea.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 100, č. 8 (2024), č. článku fiae103. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
GRANT EU: European Commission(CZ) 731065 - EU H2020-INFRAIA
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: dissolved organic-carbon * heterotrophic seawater mesocosms * extracellular enzymatic-activity * alkaline-phosphatase * bacterial communities * inorganic nutrients * protein-synthesis * phosphorus * nitrogen * dynamics * excess phosphate * extracellular enzyme activity * mesocosm * northern Baltic Sea * organic matter degradation * postspring-bloom
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 0.967, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsec/article/100/8/fiae103/7718121?login=true
Vanharanta, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355647
0639715 - MBÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Villamor, J. - Ramos-Barbero, M. D. - Moreno-Paz, M. - Villena-Alemany, Cristian - Martínez-García, M. - Parro, V. - Antón, J. - Santos, F.
Novel viruses of Haloquadratum walsbyi expand the known archaeal virosphere of hypersaline environments.
The ISME Journal. Roč. 19, č. 1 (2025), č. článku wraf149. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: single-cell genomics * cultivation * saltern * Haloquadratum * hypersaline * virome * halovirus * halophile * archaeal virus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 10, rok: 2024 ; AIS: 3.632, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/ismej/article/19/1/wraf149/8205509?login=true
Santos, F.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370155
0571448 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Villena-Alemany, Cristian - Mujakić, Izabela - Porcal, Petr - Koblížek, Michal - Piwosz, K.
Diversity dynamics of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in a freshwater lake.
Environmental Microbiology Reports. Roč. 15, č. 1 (2023), s. 60-71. ISSN 1758-2229. E-ISSN 1758-2229
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: semi-micro determination * bacterioplankton * bacterioplankton * communities * bacteriochlorophyll * photoheterotrophs * abundant
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 3.6, rok: 2023 ; AIS: 0.954, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://ami-journals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1758-2229.13131
Piwosz, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342667
0644169 - MBÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Villena-Alemany, Cristian - Vrdoljak Tomaš, A. - Mujakić, Izabela - Kopejtka, Karel - Šantić, D. - Koblížek, Michal
Lineage-specific phototrophy and lifestyle of coastal marine aerobic anoxygenic phototrophs.
Ocean Microbiology. Roč. 1, September 25 (2025), č. článku 5. E-ISSN 3005-107X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624; GA ČR(CZ) GA25-16833S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Marine environment * Microbial community * Aerobic anoxygenic phototrophs * Gene expression * Particleattached bacteria * Free-living bacteria, Photoheterotrophy
Obor OECD: Microbiology
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1186/s44375-025-00005-x
Koblížek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373946
0585489 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Villena-Alemany, Cristian - Mujakić, Izabela - Fecskeová, L. K. - Woodhouse, J. - Auladell, A. - Dean, Jason Lawrence - Hanusová, Martina - Socha, M. - Gazulla, C. R. - Ruscheweyh, H. - Sunagawa, S. - Kavagutti, V. S. - Andrei, A. - Grossart, H. - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal - Piwosz, Kasia
Phenology and ecological role of aerobic anoxygenic phototrophs in freshwaters.
Microbiome. Roč. 12, č. 1 (2024), č. článku 65. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: semi-micro determination * peg-model * diversity * bacteria * gene * growth * populations * evolution * atlantic * database * Freshwaters * Aquatic microbial ecology * Microbial seasonal succession * Long-term sampling * Aerobic anoxygenic phototrophs * pufM gene * PEG model * Photoheterotrophs
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 12.7, rok: 2024 ; AIS: 4.38, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01786-0
Villena-Alemany, Cristian Piwosz, Kasia
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353176