Publikace ASEP
0603767 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brezovská, Barbora - Narasimhan, S. - Šiková, Michaela - Šanderová, Hana - Kovaľ, Tomáš - Borah, Nabajyoti - Shoman, Mahmoud - Pospíšilová, Debora - Hausnerová Vaňková, Viola - Tužinčin, D. - Černý, M. - Komárek, J. - Janoušková, Martina - Kambová, Milada - Halada, Petr - Křenková, Alena - Hubálek, Martin - Trundová, Mária - Dohnálek, Jan - Hnilicová, Jarmila - Zídek, L. - Krásný, Libor
MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σ A in Mycobacterium smegmatis.
Journal of Bacteriology. Roč. 206, č. 12 (2024), č. článku e00066-24. ISSN 0021-9193. E-ISSN 1098-5530
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-12956S; GA ČR(CZ) GA22-12023S; GA ČR(CZ) GA23-05622S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT LM2023042; GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: escherichia-coli regulator * rna-polymerase * bacillus-subtilis * crystal-structure * stress-response * differential expression * stationary-phase * larger proteins * tuberculosis * molybdenum * MoaB2 * sigma(A) * mycobacteria * RNA polymerase * transcription
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3, rok: 2024 ; AIS: 1.052, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/jb.00066-24
Hnilicová, Jarmila
- Zídek, L.
- Krásný, Libor
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361080
0643704 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shoman, Mahmoud - Černý, M. - Jirát Matějčková, J. - Schwarz, Marek - Borah, Nabajyoti - Vaňková Hausnerová, V. - Neva, S. - Šiková, Michaela - Šanderová, Hana - Halada, Petr - Hubálek, Martin - Dvořáková, V. - Převorovský, M. - Holubová, Jana - Staněk, Ondřej - Krásný, Libor - Žídek, L. - Hnilicová, Jarmila
Expanding the CarD interaction network: CrsL is a novel transcription regulator in actinobacteria.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 22 (2025), č. článku gkaf1342. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05622S; GA ČR(CZ) GA22-12023S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR CZ III - 90255; CIISB III - 90242; EATRIS-CZ IV - 90253
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: mycobacterial rna-polymerase * gene-expression * sigma-factors * trehalose biosynthesis * phenotypic tolerance * nmr-spectroscopy * shock proteins * tuberculosis * cold * helicases
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Analytical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/53/22/gkaf1342/8382376?login=true
Hnilicová, Jarmila
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373605
0558580 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková Hausnerová, Viola - Marvalová, Olga - Šiková, Michaela - Shoman, Mahmoud - Havelková, Jarmila - Kambová, Milada - Janoušková, Martina - Kumar, Dilip - Halada, Petr - Schwarz, Marek - Krásný, Libor - Hnilicová, Jarmila - Pánek, Josef
Ms1 RNA Interacts With the RNA Polymerase Core in Streptomyces coelicolor and Was Identified in Majority of Actinobacteria Using a Linguistic Gene Synteny Search.
Frontiers in Microbiology. Roč. 13, MAY 11 2022 (2022), č. článku 848536. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: 6s rna * escherichia-coli * sp-nov. * short transcripts * noncoding rnas * glycomyces * release * growth * sequence * requires * sRNA * Actinobacteria * Ms1 RNA * Streptomyces * gene synteny * Mycobacterium * 6s rna
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022 ; AIS: 1.159, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.848536/full
Pánek, Josef
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0332218
0582831 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková Hausnerová, Viola - Shoman, Mahmoud - Kumar, Dilip - Schwarz, Marek - Modrák, Martin - Jirát Matějčková, Jitka - Mikesková, Eliška - Neva, Silva - Herrmannová, Anna - Šiková, Michaela - Halada, Petr - Novotná, I. - Pajer, J. - Valášek, Leoš Shivaya - Převorovský, M. - Krásný, Libor - Hnilicová, Jarmila
RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and primary sigma factors in bacteria.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, May 8 (2024), s. 4604-4626. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974; GA ČR(CZ) GA23-05622S
AV ČR(CZ) Premium Academiae of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Akademická prémie - Praemium Academiae
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: RIP-seq reveals * RNA polymerase * 6S RNA * Ms1 RNA
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae081/7606967?login=true
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0350882