Publikace ASEP
0597817 - MBÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Battersby, J. L. - Stevens, D. A. - Coutts, R. H. A. - Havlíček, Vladimír - Hsu, J. L. - Sass, G. - Kotta-Loizou, I.
The Expanding Mycovirome of Aspergilli.
Journal of Fungi. Roč. 10, č. 8 (2024), č. článku jof10080585. E-ISSN 2309-608X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LUAUS24214; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: mycovirus * Aspergillus * Polymycovirus * RNA sequencing * hypovirulence * oxidative stress * mycovirus-host interactions * aspergillosis * Pseudomonas aeruginosa * mycotoxins * RNA silencing * antifungal treatment * phage therapy
Obor OECD: Mycology
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 0.891, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2309-608X/10/8/585
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355636
0556633 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobiáš, R. - Kaňová, M. - Petejová, N. - Pisti, S. K. - Boček, R. - Krejčí, E. - Stružková, H. - Cachová, M. - Tomášková, H. - Hamal, P. - Havlíček, Vladimír - Raška, M.
Combined Use of Presepsin and (1,3)-beta-D-glucan as Biomarkers for Diagnosing Candida Sepsis and Monitoring the Effectiveness of Treatment in Critically Ill Patients.
Journal of Fungi. Roč. 8, č. 3 (2022), č. článku 308. E-ISSN 2309-608X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: intensive-care units * invasive candidiasis * prognostic marker * apache-ii * multicenter * procalcitonin * scd14-st * accuracy * kinetics * disease * sepsis * Candida * bloodstream infections * presepsin * procalcitonin * C-reactive protein * (1,3)-beta-D-glucan
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 4.7, rok: 2022 ; AIS: 0.978, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2309-608X/8/3/308
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0331533
0571234 - MBÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobiáš, R. - Stevens, D. A. - Havlíček, Vladimír
Current and Future Pathways in Aspergillus Diagnosis.
Antibiotics (Basel). Roč. 12, č. 2 (2023), č. článku 385. ISSN 2079-6382. E-ISSN 2079-6382
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-06771S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aspergillosis * galactomannan * beta-D-glucan * pcr * metagenomic next-generation sequencing * lateral flow * bronchoalveolar lavage fluid * serum assays * siderophore * metallophore
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2023 ; AIS: 0.839, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2079-6382/12/2/385
Stevens, D. A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342506
0636233 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dobiáš, R. - Navrátil, M. - Patil, Rutuja Hiraji - Luptáková, Dominika - Stevens, D. A. - Havlíček, Vladimír
Detection of Siderophores as a Superior Noninvasive Diagnostic Tool in Unraveling Mixed Fungal Infections.
ACS Omega. Roč. 10, č. 21 (2025), s. 21908-21914. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU23-05-00095; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aspergillosis * Anatomy * Antimicrobial agents * Genetics * Infectious diseases * Serum
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.5c01914
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0367190
0571794 - MBÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobiáš, R. - Jahn, P. - Tóthová, K. - Dobešová, O. - Višňovská, D. - Patil, Rutuja Hiraji - Škríba, Anton - Jaworská, P. - Škorič, M. - Podojil, L. - Kantorová, M. - Mrázek, J. - Krejčí, E. - Stevens, D. A. - Havlíček, Vladimír
Diagnosis of Aspergillosis in Horses.
Journal of Fungi. Roč. 9, č. 2 (2023), č. článku 161. E-ISSN 2309-608X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: equine aspergillosis * invasive pulmonary aspergillosis * bronchoalveolar lavage fluid * tracheal wash * serum * galactomannan * (1,3)-beta-D-glucan * fungal secondary metabolites * equine herpes virus-5 * equine asthma * guttural pouch
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2023 ; AIS: 0.875, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2309-608X/9/2/161
Dobiáš, R.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342693
0565573 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobiáš, R. - Jaworská, P. - Skopelidou, V. - Strakoš, J. - Višňovská, D. - Káňová, M. - Škríba, Anton - Lysková, P. - Bartek, T. - Janíčková, I. - Kozel, R. - Cwiková, L. - Vrba, Z. - Navrátil, M. - Martinek, J. - Coufalová, P. - Krejčí, E. - Ulmann, V. - Raška, M. - Stevens, D. A. - Havlíček, Vladimír
Distinguishing Invasive from Chronic Pulmonary Infections: Host Pentraxin 3 and Fungal Siderophores in Bronchoalveolar Lavage Fluids
.
Journal of Fungi. Roč. 8, č. 11 (2022), č. článku 1194. E-ISSN 2309-608X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: invasive fungal disease * pulmonary aspergillosis * bronchoalveolar lavage fluid * pentraxin-3 * triacetylfusarinine C * non-neutropenic
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2022 ; AIS: 0.978, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2309-608X/8/11/1194
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0337112
0637560 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dobiáš, R. - Skopelidou, V. - Sermeno, A. L. - Strakoš, J. - Luptáková, Dominika - Tomášková, H. - Raška, M. - Škarda, J. - Bázsóová, D. - Havlíček, Vladimír
Time- and temperature-dependent Pentraxin 3 stability in serum and bronchoalveolar lavage fluid samples.
Medical Mycology. Roč. 63, č. 7 (2025), č. článku myaf057. ISSN 1369-3786. E-ISSN 1460-2709
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU23-05-00095; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: beta * Pentraxin 3 * biomarker * stability * Aspergillosis * serum * bronchoalveolar lavage fluid * storage * enzyme immunoassay * preservation
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.3, rok: 2024 ; AIS: 0.739, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mmy/article/63/7/myaf057/8176677?login=true
Škarda, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368414
0641452 - BTÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Endaya, Berwini - Kučera, Lukáš - Le, Thi Dan Diem - Spinelli, J. B. - Brozkova, A. - Luptáková, Dominika - Klíma, Kryštof - Oliveira, Gabriela L. - Brisudová, Petra - Boháčová, Klára - Boukalová, Štěpána - Zobalová, Renata - Kolář, František - Chalupský, Karel - Dohnalová, Klára - Yarmohammadi-Barzegar, A. - Dvořáková, Šárka - Biryukova, Evgeniya - Kaliaeva, Marta - Havlíček, Vladimír - Sedláček, Radislav - Procházka, Jan - Vítek, L. - Park, S. - Martásek, P. - Krška, Z. - Oliveira, P. J. - Berridge, M.V. - Neužil, Jiří
Regenerating liver uses ammonia to support de novo pyrimidine synthesis and cell proliferation.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 9664. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX21-04607X; GA MZd(CZ) NU23-03-00226; GA ČR(CZ) GA23-05303S; GA MZd(CZ) NU22-08-00160; GA ČR(CZ) GA23-04671S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050 ; RVO:61388971 ; RVO:67985823
Klíčová slova: urea cycle * dihydroorotate dehydrogenase * mitochondrial-function * dna-synthesis * metabolism
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemical research methods (MBU-M); Biochemistry and molecular biology (FGU-C)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-025-65451-2
Endaya, Berwini Neužil, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371615
0600389 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Houšť, Jiří - Palyzová, Andrea - Pluháček, Tomáš - Novák, Jiří - Marešová, Helena - Hubáček, P. - Dobiáš, R. - Stevens, D. A. - Guegan, H. - Gangneux, J. - Havlíček, Vladimír
Exploring the Siderophore Portfolio for Mass Spectrometry-Based Diagnosis of Scedosporiosis and Lomentosporiosis.
ACS Omega. Roč. 9, č. 44 (2024), s. 44815-44824. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: iron acquisition * prolificans * database * apiospermum * infection * peptides
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/epdf/10.1021/acsomega.4c08257?ref=article_openPDF
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357717
0639580 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hrbáček, J. - Pluháček, Tomáš - Novák, Jiří - Palyzová, Andrea - Luptáková, Dominika - Houšť, Jiří - Stevens, D. A. - Dobiáš, R. - Zachoval, R. - Havlíček, Vladimír
Potential Utility of Combined Urine Lipocalin-2 and Copper Test in Diagnosing Acute Pyelonephritis or Cystitis.
ACS Omega. Roč. 10, č. 38 (2025), s. 44291-44297. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-06771S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: yersiniabactin * siderophores * infection * disease
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.5c05922
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370006
0564787 - MBÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kriegl, L. - Havlíček, Vladimír - Dichtl, K. - Egger, M. - Hoenigl, M.
Siderophores: a potential role as a diagnostic for invasive fungal disease.
Current Opinion in Infectious Diseases. Roč. 35, č. 6 (2022), s. 485-492. ISSN 0951-7375. E-ISSN 1473-6527
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: diagnostics * invasive fungal infections * siderophores * triacetylfusarinine C
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 1.295, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.lww.com/co-infectiousdiseases/Abstract/2022/12000/Siderophores__a_potential_role_as_a_diagnostic_for.2.aspx
Hoenigl, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336378
0598020 - MBÚ 2025 US eng J - Článek v odborném periodiku
Lemr, K. - Havlíček, Vladimír
Editorial: Frank Turecek Laudation.
Mass Spectrometry Reviews. Roč. 43, č. 3 (2024), s. 411-412. ISSN 0277-7037. E-ISSN 1098-2787
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Frank Turecek
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 6.6, rok: 2024 ; AIS: 1.869, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://analyticalsciencejournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mas.21859
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355797
0571470 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Luptáková, Dominika - Patil, Rutuja Hiraji - Dobiáš, R. - Stevens, D. A. - Pluháček, Tomáš - Palyzová, Andrea - Káňová, M. - Navrátil, M. - Vrba, Z. - Hubáček, P. - Havlíček, Vladimír
Siderophore-Based Noninvasive Differentiation of Aspergillus fumigatus Colonization and Invasion in Pulmonary Aspergillosis.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, č. 2 (2023), č. článku 04068-22. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Aspergillus fumigatus * colonization * invasive pulmonary aspergillosis * iron metabolism * mass spectrometry * noninvasive diagnosis * siderophore * urine analysis
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 1.02, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.04068-22
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342685
0584678 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mácha, Hynek - Zápal, Jakub - Kuzma, Marek - Luptáková, Dominika - Lemr, Karel - Havlíček, Vladimír
Exploring the Effects of Cyclosporin A to Isocyclosporin A Rearrangement on Ion Mobility Separation.
Analytical Chemistry. Roč. 96, č. 10 (2024), s. 4163-4170. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Cyclosporin A * socyclosporin A * massspectrometry
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 6.7, rok: 2024 ; AIS: 1.132, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.3c05165
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0352586
0588467 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mácha, Hynek - Luptáková, Dominika - Juránek, I. - Andren, P. E. - Havlíček, Vladimír
Hypoxic-Ischemic Insult Alters Polyamine and Neurotransmitter Abundance in the Specific Neonatal Rat Brain Subregions.
ACS Chemical Neuroscience. Roč. 15, č. 15 (2024), s. 2811-2821. ISSN 1948-7193. E-ISSN 1948-7193
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-06771S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy * MALDI massspectrometry imaging * metabolome dynamics * histology * cerebrospinal fluid * polyamines * neurotransmitters
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 0.91, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschemneuro.4c00190
Juránek, I.
- Andren, P. E.
- Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355478
0564336 - MBÚ 2023 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Novák, Jiří - Havlíček, Vladimír
Dereplikace látek a de novo charakterizace malých molekul z hmotnostních spekter.
[Compound Dereplication and De Novo Characterization of Small Molecules by Mass Spectrometry.]
Chemické listy. Roč. 116, č. 1 (2022), s. 11-19. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: CycloBranch * dereplication * de novo characterization * mass spectrometry * metabolomic * mass spectrometry imaging * liquid chromatography * isotopic structure
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 0.6, rok: 2022 ; AIS: 0.022, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
http://chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/3983
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336009
0571233 - MBÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, Jiří - Schug, K. A. - Havlíček, Vladimír
Quantitation of small molecules from liquid chromatography-mass spectrometric accurate mass datasets using CycloBranch.
European Journal of Mass Spectrometry. Roč. 29, č. 2 (2023), s. 102-110. ISSN 1469-0667
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-06771S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Siderophores * dereplication * annotation * quantitation * mass spectrometry * high resolution
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 1.1, rok: 2023 ; AIS: 0.194, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.sagepub.com/doi/10.1177/14690667231164766
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342505
0573083 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Patil, Rutuja Hiraji - Luptáková, Dominika - Havlíček, Vladimír
Infection metallomics for critical care in the post-COVID era.
Mass Spectrometry Reviews. Roč. 42, č. 4 (2023), s. 1221-1243. ISSN 0277-7037. E-ISSN 1098-2787
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17044S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: diagnosis * infection * isotope pattern * mass spectrometry * metallophore
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.868, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://analyticalsciencejournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mas.21755
Havlíček, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0343691