Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

RIV - aktuální sběr

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 293

Článek v odborném periodiku

0603228 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schmidt, N. - Stappert, N. - Nimura-Matsune, K. - Watanabe, S. - Sobotka, Roman - Hagemann, M. - Hess, W. R.
Epigenetic control of tetrapyrrole biosynthesis by m4 C DNA methylation in a cyanobacterium.
Dna Research. Roč. 31, č. 6 (2024), č. článku dsae035. ISSN 1340-2838. E-ISSN 1756-1663
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: protoporphyrinogen ix oxidase * sp pcc 6803 * escherichia-coli * rna-polymerase * transcription initiation * recognition * n4-methylcytosine * identification * ferrochelatase * resistance * cyanobacteria * epigenetic modifications * HemJ * DNA methyltransferase * tetrapyrrole biosynthesis
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.9, rok: 2024 ; AIS: 1.192, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/dnaresearch/article/31/6/dsae035/7918679?login=true
Hagemann, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360612

0588258 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schreiber, J. - Baldrian, Petr - Brabcová, Vendula - Brandl, R. - Kellner, H. - Mueller, J. - Roy, F. - Bassler, C. - Krah, Franz-Sebastian
Effects of experimental canopy openness on wood-inhabiting fungal fruiting diversity across succession.
Scientific Reports. Roč. 14, č. 1 (2024), č. článku 16135. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC21-09334J
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: old-growth forest * environmental fluctuations * decomposition rates * species-diversity * dead wood * climate * debris * microclimate * variability * macrofungi * Succession * Microclimate * Canopy mortality * Climate change * Fungi * Dead wood * Forest management
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B)
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-024-67216-1
Krah, Franz-Sebastian
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355216

0579697 - ÚMCH 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Skleničková, Kateřina - Suchopárová, E. - Abbrent, Sabina - Pokorný, Václav - Kočková, Olga - Nevoralová, Martina - Cajthaml, Tomáš - Strejček, M. - Uhlík, O. - Halecký, M. - Beneš, Hynek
Biodegradation of aliphatic polyurethane foams in soil: influence of amide linkages and supramolecular structure.
Science of the Total Environment. Roč. 912, 20 February (2024), č. článku 169062. ISSN 0048-9697. E-ISSN 1879-1026
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-08549S
Institucionální podpora: RVO:61389013 ; RVO:61388971
Klíčová slova: polyurethane foam * amide bond * biodegradation
Obor OECD: Polymer science; Environmental sciences (social aspects to be 5.7) (MBU-M)
Impakt faktor: 8, rok: 2024 ; AIS: 1.513, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969723076921?via%3Dihub
Beneš, Hynek
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348524

0598265 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Skotnicová, Petra - Srivastava, Amit - Aggarwal, Divya - Talbot, Jana - Karlínová, I. - Moos, M. - Mareš, Jan - Bučinská, Lenka - Koník, Peter - Šimek, P. - Tichý, Martin - Sobotka, Roman
A thylakoid biogenesis BtpA protein is required for the initial step of tetrapyrrole biosynthesis in cyanobacteria.
New Phytologist. Roč. 241, č. 3 (2024), s. 1236-1249. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-29225X
GRANT EU: European Commission(CZ) 854126 - PhotoRedesign
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: synechocystis sp pcc-6803 * sp pcc 6803 * photosystem-ii * heat-repeats * chlorophyll * identification * membrane * isca * accumulation * stabilizes * BtpA * cyanobacteria * glutamyl-tRNA reductase * Synechocystis sp. PCC 6803 * tetrapyrrole biosynthesis
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 8.1, rok: 2024 ; AIS: 2.744, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/nph.19397
Sobotka, Roman
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355991

0584639 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Smirnova, Anna - Hronová, Vladislava - Mohammad, Mahabub Pasha - Herrmannová, Anna - Gunišová, Stanislava - Petráčková, Denisa - Halada, Petr - Coufal, Štěpán - Swirski, M. - Rendleman, J. - Jendruchová, Kristína - Hatzoglou, M. - Beznosková, Petra - Vogel, C. - Valášek, Leoš Shivaya
Stem-loop-induced ribosome queuing in the uORF2/ATF4 overlap fine-tunes stress-induced human ATF4 translational control.
Cell Reports. Roč. 43, č. 4 (2024), s. 113976. ISSN 2211-1247. E-ISSN 2211-1247
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-25821X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: ribosome * factor 4 (ATF4) * stress respon * ORF2/ATF4 overlap
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.9, rok: 2024 ; AIS: 3.464, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124724003048?via%3Dihub
Valášek, Leoš Shivaya
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0352526

0601742 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Smirnova, Anna - Herrmannová, Anna - Valášek, Leoš Shivaya
Protocol for detecting and quantifying hATF4-HA in non-stress versus stress conditions using automated and quantitative Jess western blotting.
STAR protocols. Roč. 5, č. 4 (2024), č. článku 103454. ISSN 2666-1667. E-ISSN 2666-1667
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-25821X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cell culture * gene expression * protein expression and purification
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 1.3, rok: 2024 ; AIS: 0.725, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666166724006191?via%3Dihub
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359048

0602938 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Sohaimi, K. S. A. - Jaafar, J. - Othman, M. H. D. - Rahman, M. A. - Aziz, F. - Kurniawan, Setyo Budi - Abdullah, F. - Shakhih, M. F. M.
A novel approach of photo-charging and dark-discharging mechanisms by using V2O5 / g-C3N4 photocatalysts for ciprofloxacin degradation.
Applied Catalysis B - Environmental. Roč. 357, November 15 (2024), č. článku 124233. ISSN 0926-3373. E-ISSN 1873-3883
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: carbon nitride * light * efficiency * temperature * Day-night photocatalysis * Electron storage * Ciprofloxacin * Vanadium pentoxide * Heterojunction
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 21.1, rok: 2024 ; AIS: 3.144, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926337324005472?via%3Dihub
Sohaimi, K. S. A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360225

0598309 - MBÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Solano-Baez, A. R. - Trejo-Tapia, G. - Kolařík, Miroslav - Ortiz-Alvarez, J. - Trejo-Espino, J. L. - Marquez-Licona, Guillermo
Etiology of Foliar Blight of Indian Paintbrush (Castilleja tenuiflora) in Mexico.
Microorganisms. Roč. 12, č. 8 (2024), č. článku 1714. ISSN 2076-2607. E-ISSN 2076-2607
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: multiple sequence alignment * alternaria-alternata * leaf-blight * secondary metabolites * 1st report * fungi * plant * identification * origin * primer * Alternaria * morphology * pathogenicity * phylogeny * Mexican medicinal plants * Orobanchaceae
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.894, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/12/8/1714
Kolařík, Miroslav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356331

0587190 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Spampinato, Ambra - Leone, Denise Liu - Pohl, Radek - Tarábek, Ján - Šoltysová, Markéta - Polák, Marek - Kádek, Alan - Sýkorová, Veronika - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal
ABNOH-Linked Nucleotides and DNA for Bioconjugation and Cross-linking with Tryptophan-Containing Peptides and Proteins.
Chemistry - A European Journal. Roč. 30, č. 49 (2024), č. článku e202402151. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: bioconjugation * DNA * proteins * nucleotides * oligonucleotides * peptides * N-oxyl radicals
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 0.762, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202402151
Hocek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354457

0587066 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Stadler, M. - Kolařík, Miroslav
Taxol is NOT produced sustainably by endophytic fungi ! – A case study for the damage that scientific papermills can cause for the scientific communities.
FUNGAL BIOLOGY REVIEWS. Roč. 49, September 24 (2024), č. článku 100367. ISSN 1749-4613. E-ISSN 1878-0253
GRANT EU: European Commission(CZ) 101008129 - MYCOBIOMICS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Anticancer agents * Antiproliferative drugs * Co-evolution * Horizontal gene transfer * Secondary metabolism
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.235, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1749461324000125?via%3Dihub
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354369

0598396 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Stauberová, Václava - Kubeša, Bohumil - Joseph, M. - Benedet, M. - Furlan, B. - Buriánková, Karolína - Ulrych, Aleš - Kupčík, R. - Vomastek, Tomáš - Massidda, O. - Tsui, H-Ch.T. - Winkler, M.E. - Branny, Pavel - Doubravová, Linda
GpsB coordinates StkP signaling as a PASTA kinase adaptor in Streptococcus pneumoniae cell division
.
Journal of Molecular Biology. Roč. 436, č. 22 (2024), č. článku 168797. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-11062S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cell signalling * Ser/Thr protein kinase * phosphorylation * cell division * protein-protein interaction
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283624004194?via%3Dihub
Doubravová, Linda
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356064

0585725 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Stojan, I. - Šantić, D. - Villena-Alemany, Cristian - Trumbic, Z. - Matic, F. - Tomas, A. V. - Pleic, I. L. - Piwosz, K. - Kušpilić, G. - Gladan, Z. N. - Šestanović, S. - Šolić, M.
Ecology of aerobic anoxygenic phototrophs on a fine-scale taxonomic resolution in Adriatic Sea unravelled by unsupervised neural network.
Environmental Microbiome. Roč. 19, č. 1 (2024), č. článku 28. E-ISSN 2524-6372
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: in-situ hybridization * surface waters * growth-rates * bacterioplankton groups * seasonal dynamics * mediterranean sea * bacteria * diversity * identification * abundance
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 1.543, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://environmentalmicrobiome.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40793-024-00573-6
Šantić, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353419

0600239 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Střížek, Antonín - Lukeš, Martin - Hrouzek, Pavel - Mylenko, Mykola - Lukavský, J. - Nedbalová, L. - Přibyl, P.
Alternative production of fucoxanthin and PUFAs using Chlorochromonas danica and Hibberdia magna , unicellular chrysophytes with different trophic modes.
Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts. Roč. 82, August 24 (2024), č. článku 103597. ISSN 2211-9264. E-ISSN 2211-9264
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN01000048
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: fatty-acid-composition * poterioochromonas-malhamensis * ochromonas-danica * feeding characteristics * mixotrophic flagellate * light-intensity * prey abundance * growth * alga * cultures * Fucoxanthin * Polyunsaturated fatty acids * Mixotrophy * Multi-target biorefinery * Hibberdia magna * Chlorochromonas danica
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 0.795, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211926424002091?via%3Dihub
Přibyl, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357590

0618188 - MBÚ 2025 RIV SI eng J - Článek v odborném periodiku
Suban, N. - Maksimović, O. - Šibanc, N. - Martinović, Tijana - Dařenová, Eva - Čater, M. - Grebenc, T.
The effect of forest gaps on the diversity and composition of bacterial communities in mixed-type forest soils across the Carpathian mountains.
Acta Silvae et Ligni. Roč. 135, 30.12. (2024), s. 53-64. ISSN 2335-3112. E-ISSN 2335-3953
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-47163L
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: microbial communities * altitudinal gradient * fungal communities * growth * ecosystem * ozone * beech * trees * forest gaps * forest management * soil microbiome * soil * rhizosphere * Carpathians * temperate forest
Obor OECD: Microbiology; Forestry (UEK-B)
Impakt faktor: 0.4, rok: 2024 ; AIS: 0.073, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?id=21115
Suban, N.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365000

0585459 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Sun, Daquan - Rozmoš, Martin - Kotianová, Michala - Hršelová, Hana - Jansa, Jan
Arbuscular mycorrhizal fungi suppress ammonia-oxidizing bacteria but not archaea across agricultural soils.
Heliyon. Roč. 10, č. 4 (2024), č. článku e26485. ISSN 2405-8440. E-ISSN 2405-8440
Grant CEP: GA ČR GA19-14872S; GA ČR(CZ) GA23-04690S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Arbuscular mycorrhizal (AM) fungi * Ammoniaoxidizing microorganisms (AO) * Quantitative real-time PCR (qPCR) * Agricultural soils * Land use * Cropland and grassland
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.613, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2405844024025167?via%3Dihub
Sun, Daquan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353289

0598483 - MBÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Sun, Daquan - Rozmoš, Martin - Kokkoris, V. - Kotianová, Michala - Hršelová, Hana - Bukovská, Petra - Faghihinia, Maede - Jansa, Jan
Unraveling the diversity of hyphal explorative traits among Rhizophagus irregularis genotypes.
Mycorrhiza. Roč. 34, č. 4 (2024), s. 303-316. ISSN 0940-6360. E-ISSN 1432-1890
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-07275S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: arbuscular mycorrhizal fungi * functional diversity * genetic-variability * glomus-intraradices * phosphorus * population * colonization * cooperation * sequences * exchange * Hyphosphere microbiome * Intraspecific differences * Mycorrhizal hyphal networks * Quantitative real-time PCR (qPCR) * Soil nitrogen exploration * Stable isotopic labeling and tracing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.834, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s00572-024-01154-8
Sun, Daquan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356151

0585749 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šigutová, H. - Pyszko, P. - Šigut, Martin - Czajova, K. - Kostovčík, Martin - Kolařík, Miroslav - Hařovská, Denisa - Drozd, P.
Concentration-dependent effect of plant secondary metabolites on bacterial and fungal microbiomes in caterpillar guts.
Microbiology Spectrum. Roč. 12, č. 1 (2024), č. článku 0299423. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-29971S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aspen defense chemicals * community composition * galleria-mellonella * sp-nov. * tannins * diversity * degradation * midgut * gene * identification * plant secondary metabolite * tannin * tannivin * salicylic acid * network stability * invertebrate-microbe interactions * bacterial and fungal microbiomes
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.022, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02994-23
Pyszko, P.
- Drozd, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353429

0602580 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimončík, O. - Tichý, V. - Durech, M. - Hernychová, L. - Trčka, Filip - Uhrik, L. - Bardelčík, M. - Coates, P. J. - Vojtěšek, B. - Müller, P.
Direct activation of HSF1 by macromolecular crowding and misfolded proteins.
PLoS ONE. Roč. 19, č. 11 (2024), č. článku e0312524. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: heat-shock factor-1 * molecular chaperones * stress * stability * environments * fluorescence * prion
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.6, rok: 2024 ; AIS: 0.829, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0312524
Müller, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359867

0588257 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šímová, I. - Chrupková, P. - Gardiner, Alastair T. - Koblížek, Michal - Kloz, M. - Polívka, T.
Femtosecond Stimulated Raman Spectroscopy of Linear Carotenoids.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 15, č. 29 (2024), s. 7466-7472. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: c=c stretching mode * bacteriochlorophyll energy-transfer * excited-state dynamics * internal-conversion * beta-carotene * s-1 state * transient absorption * ultrafast dynamics * triplet conversion * s-asterisk
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.176, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.4c01272
Polívka, T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355306

0598163 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Škerlová, Jana - Brynda, Jiří - Šobotník, Jan - Zákopčaník, Marek - Novák, Petr - Bourguignon, T. - Sillam-Dussès, D. - Řezáčová, Pavlína
Crystal structure of blue laccase BP76, a unique termite suicidal defense weapon.
Structure. Roč. 32, č. 10 (2024), s. 1581-1585. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: Neocapritermes taracua * colony defence * autothysis * benzoquinone * X-ray crystallography * single-wavelength anomalous diffraction * laccase * insect glycosylation * protein stabilization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Ecology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.07.015
Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355900

0586786 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šoltysová, Markéta - Škerlová, Jana - Pachl, Petr - Škubník, K. - Fábry, Milan - Sieglová, Irena - Farolfi, Martina - Grishkovskaya, I. - Babiak, M. - Nováček, J. - Krásný, Libor - Řezáčová, Pavlína
Structural characterization of two prototypical repressors of SorC family reveals tetrameric assemblies on DNA and mechanism of function.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 12 (2024), s. 7305-7320. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA23-06295S
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: central glycolytic genes * effector-binding domain * subtilis RNA polymerase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae434
Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354179

0602406 - MBÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Šplíchalová, Alla - Smidt, H. - Uenishi, H. - Šplíchal, Igor
Pig translational model in immunological research.
Frontiers in Immunology. Roč. 15, July 8 (2024), č. článku 1456470. ISSN 1664-3224. E-ISSN 1664-3224
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-15621S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: pig * microbiota * swine leukocyte antigen * milk oligosaccharides * toll-like receptor 4 * PRRS virus * germ-free
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 1.666, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/journals/immunology/articles/10.3389/fimmu.2024.1456470/full
Šplíchal, Igor
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359600
Uložit do RIV jako O

0602250 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Štefanová, I. - Bittnerová, P. - Moos, Martin - Zápal, Jakub - Kuzma, Marek - Kubec, R.
Cepathiolactols and Cepathiolactones - Two Newly Discovered Families of Organosulfur Compounds Formed in Cut Onion.
Journal of Agricultural and Food Chemistry. Roč. 72, č. 47 (2024), s. 26366-26375. ISSN 0021-8561. E-ISSN 1520-5118
Grant Agency of the University of South Bohemia(CZ) GAJU 080/2022/Z; ERDF Interreg(CZ) ATCZ52
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: allithiolane * Allium cepa * cepadithiolactone
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 0.913, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.4c08177
Kubec, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359675

0588183 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šuman, J. - Šrédlová, Kamila - Fraraccio, S. - Jeřábková, M. - Strejček, M. - Kabickova, H. - Cajthaml, Tomáš - Uhlík, O.
Transformation of hydroxylated polychlorinated biphenyls by bacterial 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
Chemosphere. Roč. 349, February 24 (2024), s. 140909. ISSN 0045-6535. E-ISSN 1879-1298
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Hydroxylated polychlorinated biphenyls * Biodegradation of xenobiotics * 2-Hydroxybiphenyl 3-monooxygenase * Ecotoxicology
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 8.1, rok: 2023 ; AIS: 1.217, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S004565352303179X?via%3Dihub
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355175

0585933 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Teixeira, P. P. C. - Vidal, A. - Teixeira, A. P. M. - Souza, I. F. - Hurtarte, L. C. C. - Silva, D. H. S. - Almeida, L. F. J. - Buegger, F. - Hammer, E. C. - Jansa, Jan - Mueller, C.W. - Silva, I. R.
Decoding the rhizodeposit-derived carbon’s journey into soil organic matter.
Geoderma. Roč. 443, March2024 (2024), č. článku 116811. ISSN 0016-7061. E-ISSN 1872-6259
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: microbial community * temperate soils * rhizosphere * stabilization * aluminum * associations * mechanisms * relevance * turnover * storage * Net rhizodeposition * 13C pulse labeling * Tropical soils * Eucalypt * Rhizosphere * Mineral-associated organic matter (MAOM) * Phospholipid fatty acids * Short-range order minerals * Metal-organic complexes
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.6, rok: 2024 ; AIS: 1.432, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016706124000405?via%3Dihub
Teixeira, P. P. C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353567

0584829 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Timkina, E. - Kulišová, M. - Palyzová, Andrea - Marešová, Helena - Maťátková, O. - Řezanka, Tomáš - Jarošová Kolouchová, I.
Isolation and characterization of multiple-stress tolerant bacteria from radon springs.
PLoS ONE. Roč. 19, č. 3 (2024), č. článku e0299532. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: radiotolerans sp nov. * radiation-resistant * genus rhodococcus * acid-composition * fatty-acids * diversity * waters * geomicrobiology * microorganisms * extremophiles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.6, rok: 2024 ; AIS: 0.829, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0299532
Timkina, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353076

0598311 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Titov, Ivan - Semerád, Jaroslav - Boháčková, Jana - Beneš, Hynek - Cajthaml, Tomáš
Microplastics meet micropollutants in a central european river stream: Adsorption of pollutants to microplastics under environmentally relevant conditions.
Environmental Pollution. Roč. 360, November 1 (2024), č. článku 124616. ISSN 0269-7491. E-ISSN 1873-6424
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-29315S
Výzkumná infrastruktura: NanoEnviCz III - 90266
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61389013
Klíčová slova: organic-compounds * sorption * polyethylene * particles * variability * degradation * desorption * mechanisms * pellets * Low-density polyethylene (LDPE) * Polyethylene terephthalate (PET) * Polyvinyl chloride (PVC) * aging * Telmisartan * Pharmaceuticals
Obor OECD: Environmental sciences (social aspects to be 5.7); Polymer science (UMCH-V)
Impakt faktor: 7.3, rok: 2024 ; AIS: 1.468, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0269749124013307?via%3Dihub
Cajthaml, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356112

0587636 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Todorović, I. - Abrouk, D. - Fierling, N. - Kyselková, Martina - Bouffaud, M.L. - Buscot, F. - Giongo, A. - Smalla, K. - Picot, A. - Rajčević, V. - Jovičić-Petrović, J. - Moënne-Loccoz, Y. - Muller, D.
Manure amendments and fungistasis, and relation with protection of wheat from Fusarium graminearum.
Applied Soil Ecology. Roč. 201, September 2024 (2024), č. článku 105506. ISSN 0929-1393. E-ISSN 1873-0272
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) 8X20052
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Pathogen suppression * Disease suppression * Fungistasis * Rhizosphere * Microbiome * Metabarcoding
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5, rok: 2024 ; AIS: 0.98, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0929139324002373?via%3Dihub
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355163

0585431 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Bílý, Tomáš - Gardiner, Alastair T. - Gardian, Zdenko - Shivaramu, Sahana - Koblížek, Michal - Kaftan, David
A photoheterotrophic bacterium from Iceland has adapted its photosynthetic machinery to the long days of polar summer.
mSystems. Roč. 9, č. 3 (2024), č. článku e0131123. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * light * database * carotenoids * stress * growth * oxygen * image * aap * gene expression * light adaptation * photosynthesis * Proteobacteria * Sediminicoccus
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.653, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01311-23
Kaftan, David
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353141

0587212 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Shivaramu, Sahana - Mujakić, Izabela - Koblížek, Michal
On the evolution of chromosomal regions with high gene strand bias in bacteria.
mBio. Roč. 15, č. 6 (2024), č. článku mbio.00602-24. ISSN 2150-7511. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: replication * genome * organization * repeats * genome organization * genome evolution * gene order * strand bias * Gemmatimonadota
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.855, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/mbio.00602-24
Tomasch, Jurgen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354468

0602212 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomisová, K. - Jarošová, V. - Maršík, P. - Bergo, A. M. - Cinek, O. - Hlinaková, L. - Klouček, P. - Janoušek, V. - Valentová, Kateřina - Havlík, J.
Mutual Interactions of Silymarin and Colon Microbiota in Healthy Young and Healthy Elder Subjects.
Molecular Nutrition & Food Research. Roč. 68, č. 22 (2024), č. článku 2400500. ISSN 1613-4125. E-ISSN 1613-4133
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04655S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Výzkumná infrastruktura: METROFOOD-CZ II - 90264; METROFOOD-CZ - 90100
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: age-related differences * gut microbiota * multi-Omics analysis * polyphenols * silymarin metabolism
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.941, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mnfr.202400500
Valentová, Kateřina
- Havlík, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359400

0583324 - FGÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vagnerová, Karla - Gazárková, T. - Vodička, Martin - Ergang, Peter - Klusoňová, Petra - Hudcovic, Tomáš - Šrůtková, Dagmar - Hermanová, Petra - Nováková, L. - Pácha, Jiří
Microbiota modulates the steroid response to acute immune stress in male mice.
Frontiers in Immunology. Roč. 15, Feb 1 (2024), č. článku 1330094. ISSN 1664-3224. E-ISSN 1664-3224
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-10845S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:61388971
Klíčová slova: immune stress * gut microbiota * germ-free * mice * anti-CD3 * steroids * steroidogenic genes
Obor OECD: Physiology (including cytology); Immunology (MBU-M)
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 1.666, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fimmu.2024.1330094
Vagnerová, Karla
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351351

0585263 - FGÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vagnerová, Karla - Hudcovic, Tomáš - Vodička, Martin - Ergang, Peter - Klusoňová, Petra - Hermanová, Petra - Šrůtková, Dagmar - Pácha, Jiří
The effect of oral butyrate on colonic short-chain fatty acid transporters and receptors depends on microbial status.
Frontiers in Pharmacology. Roč. 15, Mar 26 (2024), č. článku 1341333. ISSN 1663-9812. E-ISSN 1663-9812
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-08294S; GA ČR(CZ) GA21-10845S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:61388971
Klíčová slova: dextran sulfate * colitis * butyrate * germ-free (GF) * short chain fatty acid (SCFA) * butyrate transporters * butyrate receptors * microbiota
Obor OECD: Physiology (including cytology); Pharmacology and pharmacy (MBU-M)
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 1.019, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fphar.2024.1341333
Vagnerová, Karla
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353041

0586262 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Váchová, Libuše - Plocek, V. - Maršíková, J. - Rešetárová, Stanislava - Hatáková, L. - Palková, Z.
Differential stability of Gcn4p controls its cell-specific activity in differentiated yeast colonies.
mBio. Roč. 15, č. 5 (2024), č. článku 00689-24. ISSN 2150-7511. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18162; GA MŠMT(CZ) LTC20036
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: messenger-rna translation * transcription factor gcn4 * master regulator * gene-expression * start codon * activation * protein * starvation * mechanism * ap-1 * differentiated colonies * spatially structured populations * cell-specific regulation * proteasomal degradation * transcription factor * yeast * Saccharomyces cerevisiae
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.855, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mbio.00689-24
Palková, Z.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355155

0598272 - MBÚ 2025 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Valda, S. - Kolařík, Miroslav
Surprising discovery of Sedecula pulvinata in Central Europe – is it really a species endemic to the western USA?
Czech Mycology. Roč. 76, č. 1 (2024), s. 33-44. ISSN 1211-0981. E-ISSN 1805-1421
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: hypogeous fungi * endemism * Boletales * Boletales * ecology * distribution * GlobalFungi
Obor OECD: Microbiology
Způsob publikování: Open access
http://www.czechmycology.org/_cmo/CM76103.pdf
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355993
Uložit do RIV jako O

0601857 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valdés, James Jason - Petrash, D. A. - Konhauser, K. O.
A novel in-silico model explores LanM homologs among Hyphomicrobium spp.
Communications Biology. Roč. 7, NOV 20 (2024), č. článku 1539. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: lanthanides * LanM homologs * Hyphomicrobium
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s42003-024-07258-3
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359108

0597546 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vanharanta, M. - Santoro, M. - Villena-Alemany, Cristian - Piiparinen, J. - Piwosz, K. - Grossart, H. - Labrenz, M. - Spilling, K.
Microbial remineralization processes during postspring-bloom with excess phosphate available in the northern Baltic Sea.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 100, č. 8 (2024), č. článku fiae103. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
GRANT EU: European Commission(CZ) 731065 - EU H2020-INFRAIA
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: dissolved organic-carbon * heterotrophic seawater mesocosms * extracellular enzymatic-activity * alkaline-phosphatase * bacterial communities * inorganic nutrients * protein-synthesis * phosphorus * nitrogen * dynamics * excess phosphate * extracellular enzyme activity * mesocosm * northern Baltic Sea * organic matter degradation * postspring-bloom
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 0.967, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsec/article/100/8/fiae103/7718121?login=true
Vanharanta, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355647

0582831 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková Hausnerová, Viola - Shoman, Mahmoud - Kumar, Dilip - Schwarz, Marek - Modrák, Martin - Jirát Matějčková, Jitka - Mikesková, Eliška - Neva, Silva - Herrmannová, Anna - Šiková, Michaela - Halada, Petr - Novotná, I. - Pajer, J. - Valášek, Leoš Shivaya - Převorovský, M. - Krásný, Libor - Hnilicová, Jarmila
RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and primary sigma factors in bacteria.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, May 8 (2024), s. 4604-4626. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974; GA ČR(CZ) GA23-05622S
AV ČR(CZ) Premium Academiae of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Akademická prémie - Praemium Academiae
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: RIP-seq reveals * RNA polymerase * 6S RNA * Ms1 RNA
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae081/7606967?login=true
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350882

0598959 - BTÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková, Pavla - Pacheco-Garcia, J. L. - Loginov, Dmitry Sergej - Gomez-Mulas, A. - Kádek, Alan - Martin-Garcia, J. M. - Salido, E. - Man, Petr - Pey, A. L.
Insights into the pathogenesis of primary hyperoxaluria type I from the structural dynamics of alanine:glyoxylate aminotransferase variants.
FEBS Letters. Roč. 598, č. 4 (2024), s. 485-499. ISSN 0014-5793. E-ISSN 1873-3468
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388971
Klíčová slova: alanine-glyoxylate aminotransferase * molecular chaperones * frustration * aggregation * mutations * protein stability
Obor OECD: Biophysics; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 3, rok: 2024 ; AIS: 1.113, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/1873-3468.14800
Man, Petr
- Pey, A. L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356531

0585489 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Villena-Alemany, Cristian - Mujakić, Izabela - Fecskeová, L. K. - Woodhouse, J. - Auladell, A. - Dean, Jason Lawrence - Hanusová, Martina - Socha, M. - Gazulla, C. R. - Ruscheweyh, H. - Sunagawa, S. - Kavagutti, V. S. - Andrei, A. - Grossart, H. - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal - Piwosz, Kasia
Phenology and ecological role of aerobic anoxygenic phototrophs in freshwaters.
Microbiome. Roč. 12, č. 1 (2024), č. článku 65. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: semi-micro determination * peg-model * diversity * bacteria * gene * growth * populations * evolution * atlantic * database * Freshwaters * Aquatic microbial ecology * Microbial seasonal succession * Long-term sampling * Aerobic anoxygenic phototrophs * pufM gene * PEG model * Photoheterotrophs
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 12.7, rok: 2024 ; AIS: 4.38, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01786-0

Villena-Alemany, Cristian Piwosz, Kasia
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353176

0583326 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Visagie, C. M. - Yilmaz, N. - Kocsube, S. - Frisvad, J. C. - Hubka, Vít - Samson, R. A. - Houbraken, J.
A review of recently introduced Aspergillus, Penicillium, Talaromyces and other Eurotiales species.
Studies in Mycology. Roč. 107, č. 1 (2024), s. 1-66. ISSN 0166-0616. E-ISSN 1872-9797
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00681
GRANT EU: European Commission(XE) 101008129 - MYCOBIOMICS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: wadi-el-natron * phylogenetic revision * polyphasic taxonomy * section circumdati * penicillium * aspergillus * identification * nomenclature * fungi * soil * Accepted species list * Aspergilaceae * DNA barcodes * new taxa * nomenclature * Penicillaginaceae * phylogenetic species concept * Thermoascaceae * Trichocomaceae
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 17.1, rok: 2024 ; AIS: 5.016, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.ingentaconnect.com/content/wfbi/sim/2024/00000107/00000001/art00002

Visagie, C. M. Houbraken, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351661

0597831 - MBÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vohradský, Jiří
Quantitative Aspect of Bacillus subtilis σB Regulatory Network on a Proteome Level-A Computational Simulation.
Biology. Roč. 13, č. 8 (2024), č. článku 614. E-ISSN 2079-7737
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Bacillus subtilis * sigma B * computational modeling * protein regulatory networks * protein regulatory networks
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 0.83, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2079-7737/13/8/614
Vohradský, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355646

0602859 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vojtová, Jana - Čapek, Martin - Willeit, S. - Groušl, Tomáš - Chvalová, Věra - Kutejová, E. - Pevala, V. - Valášek, Leoš Shivaya - Rinnerthaler, M.
A fully automated morphological analysis of yeast mitochondria from wide-field fluorescence images.
Scientific Reports. Roč. 14, č. 1 (2024), č. článku 30144. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LUASK22100; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA MŠMT(CZ) 8J20AT023
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:67985823
Klíčová slova: Yeast * Mitochondria * Deep learning * Oxidative stress * Mmi1 * tctp
Obor OECD: Microbiology; Biochemical research methods (FGU-C)
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-024-81241-0
Rinnerthaler, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360177

0585278 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vrbata, David - Červený, Jakub - Kulik, Natalia - Hovorková, Michaela - Balogová, Soňa - Vlachová, Miluše - Pelantová, Helena - Křen, Vladimír - Bojarová, Pavla
Glycomimetic inhibitors of tandem-repeat galectins: Simple and efficient.
Bioorganic Chemistry. Roč. 145, April 24 (2024), č. článku 107231. ISSN 0045-2068. E-ISSN 1090-2120
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-00262S; GA MŠMT(CZ) LUC23148
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: carbohydrate-recognition * domain * lectin * oligosaccharide * optimization * expression * crystal * docking * Glycomimetic * Molecular modeling * Tandem-repeat galectin * Structure-affinity relationship * Thiodigalactoside
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.66, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0045206824001366?via%3Dihub
Bojarová, Pavla
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353049

0585590 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wang, S. - Zhang, F. - Koedooder, C. - Qafoku, O. - Basu, S. - Krisch, S. - Visser, A. - Eichner, Meri - Kessler, N. - Boiteau, Rene M. - Gledhill, M. - Shaked, Y.
Costs of Dust Collection by Trichodesmium: Effect on Buoyancy and Toxic Metal Release.
Journal of Geophysical Research-Biogeosciences. Roč. 129, č. 4 (2024), č. článku e2023JG007954. ISSN 2169-8953. E-ISSN 2169-8961
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: mineral-iron utilization * cyanobacteria trichodesmium * vertical migration * nitrogen-fixation * marine * spp. * ocean * phytoplankton * carbohydrate * cooccurrence * Trichodesmium * colony-dust interactions * buoyancy * toxic metals * biogeochemistry
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 1.249, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1029/2023JG007954

Wang, S. Shaked, Y.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353309

0586126 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Weber, P. - Bojarová, Pavla - Brouzdová, Jitka - Křen, Vladimír - Kulik, Natalia - Stütz, A.E. - Thonhofer, M. - Wrodnigg, T.M.
Diaminocyclopentane – l-Lysine Adducts: Potent and selective inhibitors of human O-GlcNAcase.
Bioorganic Chemistry. Roč. 148, July 2024 (2024), č. článku 107452. ISSN 0045-2068. E-ISSN 1090-2120
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-01948L; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Glycosidase * Inhibition * Inhibition * O-GlcNAcase * Hexosaminidase * Diaminocyclopentane * Tau protein * Alzheimer’s disease
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.66, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0045206824003572
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353722

0588255 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wennrich, J. - Holzenkamp, C. - Kolařík, Miroslav - Maier, W. - Mandi, A. - Kurtan, T. - Ashrafi, S. - Ebada, S. S. - Stadler, M.
Dactylfungins and Tetralones: Bioactive Metabolites from a Nematode-Associated Laburnicola nematophila.
Journal of Natural Products. Roč. 87, č. 7 (2024), s. 1860-1871. ISSN 0163-3864. E-ISSN 1520-6025
GRANT EU: European Commission(CZ) 101008129 - MYCOBIOMICS
AV ČR(CZ) JFS20ST-127
SEA-Europe JFS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aspergillus-fumigatus * fungus * massarineae * derivatives * flavonoids * resistance
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.732, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jnatprod.4c00623
Ebada, S. S.
- Stadler, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355758

0598373 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Wickramasinghe, N. - Vítková, M. - Zarzsevszkij, S. - Ouředníček, P. - Šillerová, H. - Ojo, O. E. - Beesley, L. - Grasserová, Alena - Cajthaml, Tomáš - Moško, Jaroslav - Hušek, Matěj - Pohořelý, Michael - Čechmánková, J. - Vácha, R. - Kulhánek, M. - Máslová, A. - Komárek, M.
Can pyrolysis and composting of sewage sludge reduce the release of traditional and emerging pollutants in agricultural soils? Insights from field and laboratory investigations.
Chemosphere. Roč. 364, September 2024 (2024), č. článku 143289. ISSN 0045-6535. E-ISSN 1879-1298
Grant CEP: GA MZe(CZ) QK21020022
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:67985858
Klíčová slova: Composted sludge * Endocrine disrupting compounds * Metal(loid)s * pfas * Pyrolysed sludge
Obor OECD: Environmental biotechnology; Environmental sciences (social aspects to be 5.7) (UCHP-M)
Impakt faktor: 8.1, rok: 2023 ; AIS: 1.217, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0045653524021878?via%3Dihub
Komárek, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356042

0599892 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wiedermannová, Jana - Babu, R. - Yuzenkova, Y.
Stochastic nature and physiological implications of 5′-NAD RNA cap in bacteria.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 19 (2024), s. 11838-11852. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: escherichia-coli * messenger-rna * ribonuclease-e * dna * transcription * polymerase * plasmid * binding * translation * initiation * non-canonical * RNA * capping
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/52/19/11838/7777146?login=true

Wiedermannová, Jana Yuzenkova, Y.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357315

0599716 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Witzgall, K. - Hesse, B. D. - Pacay-Barrientos, N. L. - Jansa, Jan - Seguel, O. - Oses, R. - Buegger, F. - Guigue, J. - Rojas, C. - Rousk, K. - Grams, T. E. E. - Pietrasiak, N. - Mueller, C. W.
Soil carbon and nitrogen cycling at the atmosphere-soil interface: Quantifying the responses of biocrust-soil interactions to global change.
Global Change Biology. Roč. 30, č. 10 (2024), č. článku e17519. ISSN 1354-1013. E-ISSN 1365-2486
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: organic-matter * microbial communities * fungal communities * use efficiency * climate-change * crusts * respiration * disturbance * ecosystems * diversity * biocrust * biological soil crusts * C cycle * climate change * dryland * dual labeling * plfa * soil organic matter
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 12, rok: 2024 ; AIS: 4.113, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/gcb.17519
Witzgall, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357222